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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003405`

染色体: Chr03 坐标: 52406972-52407911 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003405`
名称	SmilChr03G003405
描述	chaperonin CPN60-1, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52406972 - 52407911 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018976`
GeneID	`131018976`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018976`
原始查询	`LOC131018976`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperonin CPN60-1, mitochondrial-like
产物	chaperonin CPN60-1%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G23990` (HSP60) heat shock protein 60 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821983] identity=84; qcov=0.833; evalue=4.9e-36; confidence=medium
Rice	`Os03g0143400` (htpB) - identity=88; qcov=0.833; evalue=1.01e-38; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0005829 (cytosol); GO:0042026 (protein refolding); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018976

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803643.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803643.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803643.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803643.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803643.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52407470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C85
`Chr3:52407616`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B118
`Chr3:52407616`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B118
`Chr3:52407659`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A15,B71,B88,C62,C81,C86,D10
`Chr3:52407669`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B4
`Chr3:52407669`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B4
`Chr3:52407770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C85
`Chr3:52407844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B7,C58
`Chr3:52407850`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B101,B7,C58
`Chr3:52407850`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B101,B7,C58
`Chr3:52407851`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B101,B7,C58
`Chr3:52407851`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B101,B7,C58

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947660.1
CTCTACATTGTCTCAGAGGCGAAAACCTTTGTTGATCGTTGCGGAAGATGTGGAGAGTGAAGCCTTGGCTACTCTAATTATCAACAAGCTTCGAGCTGGATTAAAGGTTTGTGCTATTAAAGCTCCTGGATTTGGAGATAACAGAAAGGCCTATCTAAAGGACTTAGCAGCACTGACGAGAGGCAAGGTCATCACCAATGACCTTGGAATGAACCTTGAGAATTTCACAGAAGACATGCTTGGCTCATGCAAAAAGGTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018976
ATGAACCTTGAGAATTTCACAGAAGACATGCTTGGCTCATGCAAAAAGGTTACAGTATCAAAAGATGACACTGTTATTCTTGATGGAGCTGGTGACAAGGATGCTATTGAGGAAAGATGTAACCAGTTACGGTCAGGAATTGAGTTAAGCACCTCTGATTATGACAAGGAGAAGCTCCAGGAGAGACTCGCTAAGCTTTCTGGCGGTGTTGCTGTCTTGAAGGTAAGACTTACAATCTGCAATATCCAGGGGCACTCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803643.1
MNLENFTEDMLGSCKKVTVSKDDTVILDGAGDKDAIEERCNQLRSGIELSTSDYDKEKLQERLAKLSGGVAVLKVRLTICNIQGHSENYN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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