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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003407`

染色体: Chr03 坐标: 52413842-52414897 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003407`
名称	SmilChr03G003407
描述	uncharacterized protein At2g29880-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	52413842 - 52414897 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018977`
GeneID	`131018977`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018977`
原始查询	`LOC131018977`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784]; symbol=AT5G27260; hit=AT5G27260; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784]; symbol=AT5G27260; hit=AT5G27260; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=35.9; qcov=1.01; evalue=8.95e-57; confidence=medium
Rice	`Os03g0643100` - identity=27.2; qcov=0.421; evalue=7.39e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3); PF24769 (At2g29880_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018977

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803644.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803644.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803644.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803644.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803644.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:52413843`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B9,C72
`Chr3:52413843`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B9,C72
`Chr3:52413854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B80
`Chr3:52413854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr3:52413868`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B119,B3,C77
`Chr3:52413868`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B119,B3,C77
`Chr3:52413877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:52413879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr3:52413881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B77,B79,C76
`Chr3:52413894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	38	A6,B10,B101,B102,B106,B11,B115,B118,B123,B126,B134,B19,B26,B35,B41,B44,B53,B64,B73,B74,B80,B89,B98,B99,C21,C22,C23,C25,C26,C3,C30,C41,C47,C51,C7,C71,C74,C75
`Chr3:52413905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B73,C43
`Chr3:52413905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803644.1

323 aa

162

323

Myb_DNA-bind_3

At2g29880_C

PF12776 Myb_DNA-bind_3 18-114 aa PF24769 At2g29880_C 275-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803644.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	18	114	8.4e-18	65.8	Myb/SANT-like DNA-binding domain
`XP_057803644.1`	Pfam	`PF24769`	At2g29880_C	Domain	275	320	1e-15	58.5	At2g29880 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947661.1
ATGGGAGACTCTCAACCACAAGATTCCAAAAAAAGGGCAGTGTATGAAGCATGGACAAAGGAACAAAGTGATGCATTGTTAGATATTCTGGTTGAGTCTGCACATAGGGGATGGCGCGATAATAGTGGTATATTTAGCAAAGCCACAGTAGAGGAAAGGATATTGCCTGTTCTGAATGACAAACTTGGGTGCAATAAAAATTATAATCACTACCAAAGTCGTATCAAATGGTTTAAGAGCCGTTGGACTGCGTATTCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018977
ATGGGAGACTCTCAACCACAAGATTCCAAAAAAAGGGCAGTGTATGAAGCATGGACAAAGGAACAAAGTGATGCATTGTTAGATATTCTGGTTGAGTCTGCACATAGGGGATGGCGCGATAATAGTGGTATATTTAGCAAAGCCACAGTAGAGGAAAGGATATTGCCTGTTCTGAATGACAAACTTGGGTGCAATAAAAATTATAATCACTACCAAAGTCGTATCAAATGGTTTAAGAGCCGTTGGACTGCGTATTCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803644.1
MGDSQPQDSKKRAVYEAWTKEQSDALLDILVESAHRGWRDNSGIFSKATVEERILPVLNDKLGCNKNYNHYQSRIKWFKSRWTAYSNLMKFNSGFGYDNVTKKFTAPDEVWDAYIEAHPKDAYLRTGSFSDYDDLRLAVGNGVAVGRNAIGVGSATDARTIGVDESRGPLIEELNYDTATEAFVVLGEDDPPLSGSKSPLEPTEVPVESTQRRAPAKRSRGQFETSSGHTENSSHQELMVEIKKVTSTMDRVESLFVKRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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