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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001592`

染色体: Chr01 坐标: 29998804-30004658 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001592`
名称	SmilChr01G001592
描述	uncharacterized SmilChr01G001592
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	29998804 - 30004658 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018982`
GeneID	`131018982`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018982`
原始查询	`LOC131018982`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	T-complex protein 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838900]; symbol=AT1G22930; hit=AT1G22930; species=arabidopsis; confidence=high
产物	T-complex protein 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838900]; symbol=AT1G22930; hit=AT1G22930; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G22930` (AT1G22930) T-complex protein 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838900] identity=48.9; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0556700` (OJ1008_F08.17-1) - identity=45.9; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF05794 (Tcp11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018982

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057803651.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.60000	`XP_057803651.1`
3	Phragmoplast	Phragmoplast	0.60000	`XP_057803651.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803651.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803651.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:29999184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr1:29999273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr1:29999294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr1:30000110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7
`Chr1:30000167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B3,B86,C15,C80
`Chr1:30000511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:30000922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B104
`Chr1:30001177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:30001273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B121,B44,B83
`Chr1:30001537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B3,B86,C15,C80
`Chr1:30001598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B103,B106,C44
`Chr1:30001685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803651.1

1162 aa

581

1162

Tcp11

PF05794 Tcp11 669-1160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803651.1`	Pfam	`PF05794`	Tcp11	Family	669	1160	2.3e-60	205.6	T-complex protein 11

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947668.1
TCTTTCCAAAATGCGGCCCTCTTTTCTGATTCACGATTTCAATACAAAAGCGGAAAGGCAAAGCAATAAAAACTCCACCCTACATAAGCGAATTTTCATTCCGTTCATCTCAATTTCTCATTTCTCAATCGTCGTTATCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCATCAATACACACTCACGCCTCACGCGCGATTCTTTGAATTTAGGTTGTCTAGTATTGGTGAATTGTCGTGTCATCGGTTTCGGCTGGGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018982
ATGGAGTCGCCGGAGAGGGGGAGGCCGGTGGCCGGAATCGCTCTGGAGTTTCCGGCGAGCGACGGGGTTTTGTCGTGCTCGCCGCCGACTATTCCGACCTGGCTCCGTAGGCGTCTGTCGGAGCCGAAAACACCGCCGCCTTCTACCGTTGAGGAAATTCAGGCCAAACTTCGCGAAGCTGATCTTCGGCGACAGAAGTTCTATGAGAATTTAGCAAGTAAAGCTAGGCCAAAGGTCCGAAGCCCTTCACGGTCTTCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803651.1
MESPERGRPVAGIALEFPASDGVLSCSPPTIPTWLRRRLSEPKTPPPSTVEEIQAKLREADLRRQKFYENLASKARPKVRSPSRSSSTEDDLGQRLEAKLLAAEEKRLSILANAQMRLAKLDELRQAAKSQVEMRFKKERAELGSKVEMRVQQAEANRLHILRANRQRRATLRERTSQSLMRRISRESKYKERVCAAMCQKRAEAEKKRLSLLEAEKRRAHARGLKVQTVASSVSQQREIERSELKSKLEDRLQKARRLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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