当前解析结果
SmilChr03G003441| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003441 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003441 |
| 描述 | transcription elongation factor SPT6 homolog |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 52800646 - 52801167 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018983 |
|---|---|
| GeneID | 131018983 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018983 |
| 原始查询 | LOC131018983 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | transcription elongation factor SPT6 homolog |
| 产物 | transcription elongation factor SPT6 homolog |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018983 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057803650.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057803650.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057803650.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057803650.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803650.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:52800653 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B38,B46,C71,D10 |
Chr3:52800655 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B105,B50,C78,D7 |
Chr3:52800669 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
Chr3:52800673 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A3,C61 |
Chr3:52800674 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B59,B75,C7,C81 |
Chr3:52800678 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B106,B134,B82,C33,C52,C7 |
Chr3:52801041 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B47,B56,C66 |
Chr3:52801134 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | A9,B120,B2,B82,B91,C7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。