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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003544`

染色体: Chr03 坐标: 54081136-54082425 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003544`
名称	SmilChr03G003544
描述	arginine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54081136 - 54082425 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019000`
GeneID	`131019000`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019000`
原始查询	`LOC131019000`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	arginine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial-like
产物	arginine--tRNA ligase%2C chloroplastic/mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT4G26300` (emb1027) Arginyl-tRNA synthetase, class Ic [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828736] identity=77.8; qcov=0.898; evalue=4.52e-86; confidence=high
Rice	`Os01g0158500` - identity=72; qcov=0.915; evalue=3.03e-78; confidence=high
GO	GO:0004814 (arginine-tRNA ligase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006420 (arginyl-tRNA aminoacylation)
KEGG	-
Pfam	PF00750 (tRNA-synt_1d)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019000

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803669.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803669.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803669.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803669.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803669.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54081198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B115,B73,C78,C86
`Chr3:54081198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B73,C78,C86
`Chr3:54081212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C62,D3
`Chr3:54081229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C8
`Chr3:54081395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:54081398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:54081441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C68
`Chr3:54081441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr3:54081586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B21,B83,B95,C44
`Chr3:54081635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr3:54081644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C38
`Chr3:54081731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803669.1

176 aa

176

tRNA-synt_1d

PF00750 tRNA-synt_1d 12-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803669.1`	Pfam	`PF00750`	tRNA-synt_1d	Domain	12	160	2.1e-41	142.8	tRNA synthetases class I (R), catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947686.1
ATGGAGCTTGCTATAGCTGTTCAAAACATAAAAATTGTTGAAGAGTTTGGTGGGTACAATTATGCATCAACAGATCTTGCTGCTCTGTGGTACCGACTGAACGAGGAAAAGGCTGAATGGATTATATATGTTACTGATGTTGGCCAAAGAGAGCACTTTGAAATGCTTTTTGCTGCGGCCAAACGAGCCGGTTGGCTTCCAGCTGATGGCAGTAAGTATCCTAAAGCTAGTCATGTCGGGTTTGGGCTTGTCCTTGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019000
ATGGAGCTTGCTATAGCTGTTCAAAACATAAAAATTGTTGAAGAGTTTGGTGGGTACAATTATGCATCAACAGATCTTGCTGCTCTGTGGTACCGACTGAACGAGGAAAAGGCTGAATGGATTATATATGTTACTGATGTTGGCCAAAGAGAGCACTTTGAAATGCTTTTTGCTGCGGCCAAACGAGCCGGTTGGCTTCCAGCTGATGGCAGTAAGTATCCTAAAGCTAGTCATGTCGGGTTTGGGCTTGTCCTTGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803669.1
MELAIAVQNIKIVEEFGGYNYASTDLAALWYRLNEEKAEWIIYVTDVGQREHFEMLFAAAKRAGWLPADGSKYPKASHVGFGLVLGEDVKRFRTRSTETVKLVDLLIEAKSRCKTALIERGKDKEWTEEELDKTAEAVGYGAVKYADLKNNRTTNYTFSFDQMLNDKVSYKDHKHK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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