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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003585`

染色体: Chr03 坐标: 54486704-54488823 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003585`
名称	SmilChr03G003585
描述	rRNA biogenesis protein RRP5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	54486704 - 54488823 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019006`
GeneID	`131019006`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019006`
原始查询	`LOC131019006`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rRNA biogenesis protein RRP5-like
产物	rRNA biogenesis protein RRP5-like
Arabidopsis	`AT3G11964` (AT3G11964) RIBOSOMAL RNA PROCESSING 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820370] identity=49.7; qcov=0.605; evalue=7.94e-49; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0032040 (small-subunit processome)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019006

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803676.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803676.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803676.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803676.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803676.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:54486881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B59,B86,C25,C6
`Chr3:54486914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B140,B24,B67,C35
`Chr3:54486920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B59,B86,C25,C6
`Chr3:54486943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C55,C8
`Chr3:54486949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr3:54486979`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A4,B114,B14,B22,B27,B28,B46,B47,B52,B6,B64,B73,C34,C68,C73,D3,D4
`Chr3:54486995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:54487061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:54487097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B139,B32,C4,C48
`Chr3:54488074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:54488127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:54488373`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B110,C28,C30,C58

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947693.1
ATGGAGCGGGCGAACCAGCCACCACCACCGCGACGCACAGCGAACCACCACCACCGCGACGCACAGCGGCAGCGCCGCACACCACCAGAGCTAGGGTTTTGTCGAATCTCTGTGGGGCTGTGCGGTGGTGATGGTAGTAGCAGTGATGAGAGGCGGCGACGGTGGAGAGGACGATTCATCTCTCGACAGATCTCCCCCAGATTTCTTTGGTTTTGTTCTTCAACTAACTTGAATTTCGTCTTTGATTTTCAGATTACTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019006
ATGGAGCGGGCGAACCAGCCACCACCACCGCGACGCACAGCGAACCACCACCACCGCGACGCACAGCGGCAGCGCCGCACACCACCAGAGCTAGGGTTTTGTCGAATCTCTGTGGGGCTGTGCGGTGGTGATGGTAGTAGCAGTGATGAGAGGCGGCGACGGTGGAGAGGACGATTCATCTCTCGACAGATCTCCCCCAGATTTCTTTGGTTTTGTTCTTCAACTAACTTGAATTTCGTCTTTGATTTTCAGATTACTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803676.1
MERANQPPPPRRTANHHHRDAQRQRRTPPELGFCRISVGLCGGDGSSSDERRRRWRGRFISRQISPRFLWFCSSTNLNFVFDFQITEIKPLELRVKFGSGFNGRIHITEATDDNSADSPFSNYRVGQSLTARIVSKGNKTASSRGYNGWELSIKPSLLKGYTETSKSLSSEDINYSYGQCVSGFVYKIDPEWAWLTVSREFMAQLYILDSSCEPCELADFQKRFYVGKAISGFSSFSSLEIEGGGGHPSSPAATENREEG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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