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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003659`

染色体: Chr03 坐标: 55416844-55418325 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003659`
名称	SmilChr03G003659
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55416844 - 55418325 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019024`
GeneID	`131019024`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019024`
原始查询	`LOC131019024`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=30.4; qcov=0.795; evalue=5.25e-61; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=36.1; qcov=0.803; evalue=5.51e-83; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019024

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803695.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803695.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803695.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803695.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803695.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55416869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C61
`Chr3:55416871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr3:55416897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,C23,C55,D8
`Chr3:55416898`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr3:55416898`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr3:55416913`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B108,C56
`Chr3:55416913`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B108,C56
`Chr3:55416936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B37,C35
`Chr3:55416943`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	38	A1,A2,A20,A25,A9,B108,B110,B115,B119,B12,B124,B126,B14,B25,B27,B41,B45,B49,B51,B55,B71,B79,B80,B89,B97,C10,C29,C33,C4,C45,C60,C7,C70,C74,C85,C87,D11,D3
`Chr3:55416971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:55416986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr3:55416993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803695.1

493 aa

246

493

FAR1

MULE

PF03101 FAR1 111-200 aa PF10551 MULE 324-418 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803695.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	111	200	1.4e-15	58.5	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057803695.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	324	418	4.2e-26	91.9	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947712.1
ATGAGCTTGGATTTGAATGTTAGTTGTGGAGATTATAGTGGTGAAGATACCTCCAGTGCCAACACTAACACAACCTCATTTGGCAACAATGACGATGGGTTCGAGGATGAAGGATCAGAGGAACACAGATTTCGGATCATGAGCGGCCCGAATGAAAATGATAATGGAGATGGTGACGATGGTCCAACAGATTCGTTTCGTTCCAATAATGTTGATAATAGTCGCAATCTGCCGGAAAAAAGTGAATGTTCGGTACAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019024
ATGAGCTTGGATTTGAATGTTAGTTGTGGAGATTATAGTGGTGAAGATACCTCCAGTGCCAACACTAACACAACCTCATTTGGCAACAATGACGATGGGTTCGAGGATGAAGGATCAGAGGAACACAGATTTCGGATCATGAGCGGCCCGAATGAAAATGATAATGGAGATGGTGACGATGGTCCAACAGATTCGTTTCGTTCCAATAATGTTGATAATAGTCGCAATCTGCCGGAAAAAAGTGAATGTTCGGTACAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803695.1
MSLDLNVSCGDYSGEDTSSANTNTTSFGNNDDGFEDEGSEEHRFRIMSGPNENDNGDGDDGPTDSFRSNNVDNSRNLPEKSECSVQVSKKLVKGLIKLGCCIDTLDEVHVLYREYGRLKGFSVRKGSQSYFLNTMFVRAKFYHCSCEGSPDNKCSNDKVPVCKRQSYRCNCKAKLRVCRYDVESPWKVTVFETHHNHKLLHPSESYLLRSARNMSQSKKTLLIALTSSGIGVSRAYRFLENEAGSRAIIGFLRKDVYNEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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