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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003747`

染色体: Chr03 坐标: 56532939-56536077 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003747`
名称	SmilChr03G003747
描述	probably inactive receptor-like protein kinase At5g41680
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56532939 - 56536077 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019035`
GeneID	`131019035`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019035`
原始查询	`LOC131019035`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probably inactive receptor-like protein kinase At5g41680
产物	probably inactive receptor-like protein kinase At5g41680
Arabidopsis	`AT5G41680` (AT5G41680) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834170] identity=40.5; qcov=0.862; evalue=1.79e-49; confidence=medium
Rice	`Os01g0223600` - identity=40.5; qcov=0.901; evalue=7.92e-53; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019035

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803703.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803703.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803703.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803703.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803703.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56532945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,C3,C48,C62,D11
`Chr3:56532946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B124,B23,B69
`Chr3:56532953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B123,C70
`Chr3:56532958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:56532977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B44,B47,C86
`Chr3:56534765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B111,B52,C61
`Chr3:56535068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	138	A1,A11,A15,A20,A22,A23,A25,A3,B102,B103,B104,B105,B107,B108,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B120,B121,B123,B128,B130,B134,B137,B139,B14,B140,B15,B19,B21,B23,B25,B26,B27,B3,B30,B31,B32,B34,B37,B38,B39,B41,B45,B46,B47,B5,B51,B53,B54,B57,B61,B62,B64,B65,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B86,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B95,C1,C11,C13,C15,C17,C18,C2,C21,C22,C23,C25,C26,C29,C3,C31,C33,C35,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C48,C49,C5,C50,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C63,C65,C67,C69,C71,C75,C76,C79,C80,C82,C84,C85,C86,D10,D11,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr3:56535099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr3:56535121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B5,B53,B64
`Chr3:56535304`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B28,B97,C28,C40,C9
`Chr3:56535304`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B28,B97,C28,C40,C9
`Chr3:56535352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803703.1

304 aa

152

304

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 19-277 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 23-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803703.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	19	277	7.2e-17	62.4	Protein kinase domain
`XP_057803703.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	23	196	1.7e-17	64.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947720.1
ATGGCGGCGGTCCGGCTGACTGCTGCTGTCGGCTGGAGCAGAGAATTGGGGTGTGACAACTGTGCTACGGGAACTAAAGCCGTCATCAAGCTACTGAATACTGTGAAGATAACAGAAGATGAATTCGAGCAGCATATGATTGTCTTGGGAAATTGTGTGCATGAAAATGTGGCAACGCCGAGGGCGCACCGCTTCTCGGAGATGACGAAGCTCATCGTCTATGATTACTATAGCCAAGGAAGTGTGTTTGATATGTTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019035
ATGGCGGCGGTCCGGCTGACTGCTGCTGTCGGCTGGAGCAGAGAATTGGGGTGTGACAACTGTGCTACGGGAACTAAAGCCGTCATCAAGCTACTGAATACTGTGAAGATAACAGAAGATGAATTCGAGCAGCATATGATTGTCTTGGGAAATTGTGTGCATGAAAATGTGGCAACGCCGAGGGCGCACCGCTTCTCGGAGATGACGAAGCTCATCGTCTATGATTACTATAGCCAAGGAAGTGTGTTTGATATGTTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803703.1
MAAVRLTAAVGWSRELGCDNCATGTKAVIKLLNTVKITEDEFEQHMIVLGNCVHENVATPRAHRFSEMTKLIVYDYYSQGSVFDMLHGGNTNGNRPNWERRVRIAAGAAQGIAHIHTQCGGKLAHGNIKSSNIFVNSQGYGCVCDFGLAGLPGMAAKWWDALEYYTSEHSFKSPSQESDVYSFGMFLVELVTGKLPVLLPYLVNLLCTSEPDTLDFNVFKPSLFADELGSVEMEVGKFPADSDLNSWCVEELRRTLVLAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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