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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003927`

染色体: Chr03 坐标: 58351322-58352302 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003927`
名称	SmilChr03G003927
描述	expansin-B4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58351322 - 58352302 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019065`
GeneID	`131019065`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019065`
原始查询	`LOC131019065`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-B4-like
产物	expansin-B4-like
Arabidopsis	`AT2G45110` (EXPB4) expansin B4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819118] identity=54.1; qcov=0.975; evalue=2.1e-80; confidence=high
Rice	`Os02g0658600` (OsEXPB14) - identity=50.6; qcov=0.992; evalue=7.44e-78; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0019953 (sexual reproduction)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019065

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057803728.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057803728.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803728.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803728.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803728.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58351714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr3:58351716`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A1,B107,B108,B3,C12,C41
`Chr3:58351764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr3:58352009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C53
`Chr3:58352045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,B91
`Chr3:58352077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,B91
`Chr3:58352130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,C74
`Chr3:58352138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:58352172`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B130,B67,C8
`Chr3:58352172`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B130,B67,C8
`Chr3:58352198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:58352298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803728.1

237 aa

118

237

DPBB_1

Expansin_C

PF03330 DPBB_1 49-129 aa PF01357 Expansin_C 140-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803728.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	49	129	1.8e-16	60.9	Lytic transglycolase
`XP_057803728.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	140	221	2.2e-19	70.0	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947745.1
ATGCCTTCGGAGTTAGGGAATGCTACACTAGCTGCTTTCTCAACGGCCGTTGCTACGTGGTACGGCAGTCCCACCGGAGCAGGAAGTGGCGGAGCTTGTGGTTTTGAAAATGATGTGATAAATGCTCCTTACTATGGCATGATTTCTGCTGGAAACCAAAAAATATTTAGATCTGGAGCTGGTTGTGGGACTTGTTACTCGATAAAATGCAGTGAAAATCCATCTTGCTCAGGAGCTCCAATAAGTGTAACAATCACAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019065
ATGCCTTCGGAGTTAGGGAATGCTACACTAGCTGCTTTCTCAACGGCCGTTGCTACGTGGTACGGCAGTCCCACCGGAGCAGGAAGTGGCGGAGCTTGTGGTTTTGAAAATGATGTGATAAATGCTCCTTACTATGGCATGATTTCTGCTGGAAACCAAAAAATATTTAGATCTGGAGCTGGTTGTGGGACTTGTTACTCGATAAAATGCAGTGAAAATCCATCTTGCTCAGGAGCTCCAATAAGTGTAACAATCACAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803728.1
MPSELGNATLAAFSTAVATWYGSPTGAGSGGACGFENDVINAPYYGMISAGNQKIFRSGAGCGTCYSIKCSENPSCSGAPISVTITDECPGACNNEPFHFDLSGKAFGSLAKRGQADALRKAGRINVQYTRIRCRYKSNIAFKIDKGSNPFYLSFAVEDVNGDGELAGVAILPQGWKSWAPMQRVFGETWKFDVPSAAAGPYSVRLTDSTRTSVVARNVIPVNWAPQKTYYSIVNFA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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