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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003934`

染色体: Chr03 坐标: 58399608-58400327 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003934`
名称	SmilChr03G003934
描述	uncharacterized SmilChr03G003934
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58399608 - 58400327 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019067`
GeneID	`131019067`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019067`
原始查询	`LOC131019067`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=26; qcov=0.87; evalue=3.48e-10; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=25.8; qcov=0.828; evalue=6.68e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019067

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803730.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803730.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803730.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803730.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803730.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58399608`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	B35,B59,B69,C11,C15,C16,C38,C43,C48,C52,C63,C83,C87,D9
`Chr3:58399609`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B115,C39,C44,D8
`Chr3:58399609`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B115,C39,C44,D8
`Chr3:58399613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:58399620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr3:58399632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C38,C43,C48
`Chr3:58399665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr3:58399694`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B92,C1,C13,C40,D11
`Chr3:58399694`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B92,C1,C13,C40,D11
`Chr3:58399708`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A24,B96,D8
`Chr3:58399708`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A24,B96,D8
`Chr3:58399711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803730.1

239 aa

120

239

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 142-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803730.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	142	236	7e-13	49.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947747.1
ATGGGGGGGAACGAGGGTTGTTGTGTAAGGGAGGGATGGATGAAGGGAGGGAGGGGGGGAGGGTGGTGGCTGAAAGTTCTTGATGTCGGGGGAGTGCGGCTGGGGGGGTGGTTCTTTGAGAATTTATCACGTCATGTGGGGAATGGTAGGGATACGAAACTTTGGGTTGACAGGTGGGTGGGAGGAAAACCTTTGAGATTTGTTTTCCCTAGACTCTTCCAGCTCTGTGAAAATAAGAATGTGTCTATTGAAGAGTCGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019067
ATGGGGGGGAACGAGGGTTGTTGTGTAAGGGAGGGATGGATGAAGGGAGGGAGGGGGGGAGGGTGGTGGCTGAAAGTTCTTGATGTCGGGGGAGTGCGGCTGGGGGGGTGGTTCTTTGAGAATTTATCACGTCATGTGGGGAATGGTAGGGATACGAAACTTTGGGTTGACAGGTGGGTGGGAGGAAAACCTTTGAGATTTGTTTTCCCTAGACTCTTCCAGCTCTGTGAAAATAAGAATGTGTCTATTGAAGAGTCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803730.1
MGGNEGCCVREGWMKGGRGGGWWLKVLDVGGVRLGGWFFENLSRHVGNGRDTKLWVDRWVGGKPLRFVFPRLFQLCENKNVSIEESGRWENGSWSWELKWRRELFEWEKWLVNDLIVIISDGFSCSGNSDEWRWKATKNGKFTTKSAYQIIAASRGETQSNQLSHDVLAKVWEAPAPHKVKVTAWRCLRNRVATCYNLFKRHVDLSVEEAWCNSCILREATTDHLFLTCAKIDLIWGAI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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