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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003987`

染色体: Chr03 坐标: 58896990-58897536 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003987`
名称	SmilChr03G003987
描述	uncharacterized SmilChr03G003987
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58896990 - 58897536 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019072`
GeneID	`131019072`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019072`
原始查询	`LOC131019072`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0656500` - identity=25.4; qcov=0.908; evalue=8.16e-06; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF00665 (rve)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019072

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057803736.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803736.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057803736.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803736.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803736.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58897121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr3:58897145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B88,C19,C38,C53
`Chr3:58897155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr3:58897155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:58897165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr3:58897175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B37,B44
`Chr3:58897176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B5,C16
`Chr3:58897179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C10
`Chr3:58897198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B40,B80
`Chr3:58897233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B32,D10
`Chr3:58897237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B62,B92,B97,C86
`Chr3:58897243`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A24,B10,B100,B109,B129,B130,B134,B30,B33,B47,B52,B56,B94,B97,C24,C26,C38,C59,C64,C69,C73,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803736.1

152 aa

152

rve

PF00665 rve 8-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803736.1`	Pfam	`PF00665`	rve	Domain	8	105	5.3e-20	72.3	Integrase core domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947753.1
ATGGGCGTTATGTACGCTGCATGTCCGTTCGACAAGTGGGGTATCGACATAGTCGGGAAGCTGCCCACGGCACCAGGGGGCAAATGCTTTCTGCTTGTAGCGGTGGACTACTTCTCTAAGAGGGTCGAGGCTGAGGCTGTGGGGAAAATCGATGAGGTGACTGTGGAGCGCTTCATTTGGCGGAATATATGTTGCAGATTTGGGGTCCCAAGGATCATCGTTTCTGACAACGGAACCCAGTTTACAGGGCAGAGAATCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019072
ATGGGCGTTATGTACGCTGCATGTCCGTTCGACAAGTGGGGTATCGACATAGTCGGGAAGCTGCCCACGGCACCAGGGGGCAAATGCTTTCTGCTTGTAGCGGTGGACTACTTCTCTAAGAGGGTCGAGGCTGAGGCTGTGGGGAAAATCGATGAGGTGACTGTGGAGCGCTTCATTTGGCGGAATATATGTTGCAGATTTGGGGTCCCAAGGATCATCGTTTCTGACAACGGAACCCAGTTTACAGGGCAGAGAATCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803736.1
MGVMYAACPFDKWGIDIVGKLPTAPGGKCFLLVAVDYFSKRVEAEAVGKIDEVTVERFIWRNICCRFGVPRIIVSDNGTQFTGQRIADFCDRMDITQRFVSVAHPQANGQVELANRTICEGIKKRLTQSKGKWVEELDTRRQVSQPTSPMTG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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