当前解析结果
SmilChr03G004182| 统一新 Gene ID | SmilChr03G004182 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G004182 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G004182 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 60539658 - 60542483 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131019085 |
|---|---|
| GeneID | 131019085 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019085 |
| 原始查询 | LOC131019085 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019085 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057803750.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057803750.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803750.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803750.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803750.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:60539729 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B18 |
Chr3:60539738 |
CAT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 15 | A8,B114,B138,B14,B20,B44,B57,B74,C28,C30,C51,C54,C72,C74,D8 |
Chr3:60539754 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 15 | A8,B114,B138,B14,B20,B44,B57,B74,C28,C30,C51,C54,C72,C74,D8 |
Chr3:60539820 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:60539861 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B63,C54 |
Chr3:60539862 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B63,C54 |
Chr3:60540339 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B37,B86 |
Chr3:60540406 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C78 |
Chr3:60540587 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B63,D11 |
Chr3:60540587 |
T |
TG |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B63,D11 |
Chr3:60540606 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B28,C60,D4 |
Chr3:60541029 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | A10,B113,B124,B33,B77,C24 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。