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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004220`

染色体: Chr03 坐标: 60768583-60769161 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004220`
名称	SmilChr03G004220
描述	VQ motif-containing protein 31-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60768583 - 60769161 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019088`
GeneID	`131019088`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019088`
原始查询	`LOC131019088`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	VQ motif-containing protein 31-like
产物	VQ motif-containing protein 31-like
Arabidopsis	`AT2G33780` (AT2G33780) VQ motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817945] identity=32.3; qcov=1.31; evalue=3.37e-09; confidence=low
Rice	`Os01g0747800` (OsVQ3) - identity=34.4; qcov=1.35; evalue=4.96e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05678 (VQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019088

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803754.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803754.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803754.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803754.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803754.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60768620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,D5
`Chr3:60768640`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	105	A1,A14,A15,A16,A21,A22,A24,A3,A7,A8,A9,B102,B103,B109,B113,B121,B122,B123,B130,B131,B132,B134,B135,B138,B14,B18,B2,B21,B23,B24,B35,B37,B40,B41,B45,B50,B52,B56,B59,B6,B60,B62,B64,B66,B67,B68,B76,B77,B81,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B96,B97,C1,C10,C11,C12,C14,C16,C19,C2,C20,C23,C27,C3,C30,C31,C32,C34,C36,C4,C40,C42,C43,C44,C47,C50,C51,C54,C55,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C73,C74,C78,C79,C80,C86,C87,C9,D10,D11,D2,D5,D7,D9
`Chr3:60768642`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	106	A1,A14,A15,A16,A21,A22,A24,A3,A7,A8,A9,B102,B103,B109,B113,B117,B120,B121,B122,B123,B130,B131,B132,B134,B135,B138,B14,B2,B21,B23,B24,B35,B37,B40,B41,B45,B50,B52,B56,B59,B6,B60,B62,B64,B66,B67,B68,B76,B77,B81,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B96,B97,C1,C10,C11,C12,C14,C16,C19,C2,C20,C23,C27,C3,C30,C31,C32,C34,C36,C4,C40,C42,C43,C44,C47,C50,C51,C54,C55,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C73,C74,C78,C79,C80,C86,C87,C9,D10,D11,D2,D5,D7,D9
`Chr3:60768659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr3:60768713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C6
`Chr3:60768812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B71,B76,B81,C34,C62
`Chr3:60768820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B71,B76,B81,C34,C62
`Chr3:60768836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B122,B35,C83
`Chr3:60768905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B23,B62,C74,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803754.1

121 aa

121

PF05678 VQ 15-35 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803754.1`	Pfam	`PF05678`	VQ	Motif	15	35	1.1e-09	38.3	VQ motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947771.1
ATGGAGAAGCAGAGAGGGGGGGTAGCAACGCCGGCGGCGGGTTTCATACAAGCAGACGCCGCCACCTTCAAAGACCTGGTGCAGAGGCTCACCGGCGCGCCGGGAAATCTCCGGCCGAAGGCGGCGGTGCCCTTCAAGCTTCGAGAGCGGAGGAAGCAGTCGTTGGGCGATCTCGAGATCGTCAAACGCGGCGCGAGATCAGCCGGGAACTCGCCGGCGAAGGGCCCCGCGACGCCGCTGGGGCGGGAATCGGTGGCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019088
ATGGAGAAGCAGAGAGGGGGGGTAGCAACGCCGGCGGCGGGTTTCATACAAGCAGACGCCGCCACCTTCAAAGACCTGGTGCAGAGGCTCACCGGCGCGCCGGGAAATCTCCGGCCGAAGGCGGCGGTGCCCTTCAAGCTTCGAGAGCGGAGGAAGCAGTCGTTGGGCGATCTCGAGATCGTCAAACGCGGCGCGAGATCAGCCGGGAACTCGCCGGCGAAGGGCCCCGCGACGCCGCTGGGGCGGGAATCGGTGGCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803754.1
MEKQRGGVATPAAGFIQADAATFKDLVQRLTGAPGNLRPKAAVPFKLRERRKQSLGDLEIVKRGARSAGNSPAKGPATPLGRESVAPSEEERAIAEKGFYLHASPAKAAPPVLLTLFPLTP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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