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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004223`

染色体: Chr03 坐标: 60786613-60788442 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004223`
名称	SmilChr03G004223
描述	premnaspirodiene oxygenase-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60786613 - 60788442 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019089`
GeneID	`131019089`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019089`
原始查询	`LOC131019089`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	premnaspirodiene oxygenase-like
产物	premnaspirodiene oxygenase-like
Arabidopsis	`AT3G26300` (CYP71B34) cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822234] identity=41.2; qcov=0.988; evalue=1.96e-128; confidence=medium
Rice	`Os03g0593600` (CYP71W1) - identity=46.7; qcov=0.984; evalue=3.37e-148; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00909 (Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019089

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057803755.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057803755.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803755.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803755.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803755.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60786614`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C6
`Chr3:60786614`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C6
`Chr3:60786636`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	54	A10,A16,A18,A22,A23,A5,A9,B102,B111,B119,B12,B120,B124,B130,B131,B132,B16,B17,B30,B35,B45,B46,B49,B5,B51,B6,B65,B74,B75,B79,B84,B86,C1,C15,C16,C18,C20,C26,C3,C33,C43,C49,C52,C55,C6,C64,C66,C75,C79,C80,C84,D5,D7,D8
`Chr3:60786638`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B118,B55,B83,B91,C15,C57,D4
`Chr3:60786650`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	A22,A23,A4,A6,B105,B109,B112,B118,B128,B13,B139,B25,B33,B41,B42,B43,B58,B70,B94,C22,C34,C49,C53,C60,C61
`Chr3:60786688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:60786690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:60786696`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	53	A1,A10,A21,A5,A9,B106,B110,B111,B12,B125,B126,B129,B137,B16,B17,B29,B30,B32,B34,B46,B49,B5,B51,B55,B58,B60,B67,B68,B75,B84,B85,B93,C18,C20,C23,C33,C38,C40,C42,C51,C52,C58,C6,C64,C66,C70,C75,C79,C8,C84,D10,D3,D6
`Chr3:60786702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:60786725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A22,B102,B112,B115,B128,B13,B139,B28,B31,B33,B41,B43,B58,B94,B98,C22,C24,C34,C35,C39,C46,C49,C60,C65,C71,C82
`Chr3:60786727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr3:60786729`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A16,B74,B79,C16,C26,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803755.1

503 aa

252

503

p450

PF00067 p450 37-485 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803755.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	37	485	1.1e-99	335.1	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947772.1
GTGTATCATTTCATCGAAAAATCTGGCCGTGCAGGCAAGATCGAACCCAAAACCTCTCACAAAAGAGAGTCTTTGGATGCCCTAACTTTGCCACTTGAACTAGACTCCATTGTCTATATAACATATGCTATTAATTACACAAATACAAGATGTTTCATACAGTTTCATGCCTTTATCTATAAAATCCGACTCAAATAGTGTATCCATGATCACACACATAAAAAAAAAATTATACTGTCACCATGGAAATCCCCTACCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019089
ATGGAAATCCCCTACCACTTTCTTCCATATTTGCTCATTTTCATCTCCTTTCTCTTCATTCTCATCCTAATCAAACTATACAAAACGTCAGGAAATCGTCGAAAATTGCCACCAGGCCCCTGGAAACTTCCTATATTGGGAAACTTGCACCAGTTGATAGGTTCACTCCCACACCATGCACTCAGAACCCTATCGCGGAAACACGGCCCCCTCATGCATATGAGCCTCGGCGAGATCCCGGTCGTCGTTGTCTCGTCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803755.1
MEIPYHFLPYLLIFISFLFILILIKLYKTSGNRRKLPPGPWKLPILGNLHQLIGSLPHHALRTLSRKHGPLMHMSLGEIPVVVVSSPRIAEEIAKTNDVAFANRVELMLPKIVLYNSTDIASAPYGDYWRFMRKLCVLEFLNHKKVRSFHSLMEDEVLHLVESVRVSQAMPVNLSRRILSTECRIICRATVGRVCRVQEPLIAIVKEAVAIGAVFNAADLFPSMRFLHLLSAGSRGRLQSMHVRADRILEDIIRQHQEKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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