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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004345`

染色体: Chr03 坐标: 61735584-61736510 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004345`
名称	SmilChr03G004345
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61735584 - 61736510 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019100`
GeneID	`131019100`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019100`
原始查询	`LOC131019100`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO2
产物	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO2
Arabidopsis	`AT5G63930` (AT5G63930) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836514] identity=40.8; qcov=0.828; evalue=1.81e-47; confidence=medium
Rice	`Os11g0559200` (Xa21*) - identity=44; qcov=0.87; evalue=8.54e-59; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF12799 (LRR_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019100

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803766.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803766.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803766.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803766.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803766.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61735599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B85,B93,C19,C2,C58
`Chr3:61735605`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A9,B111,B122,B123,B138,B139,B17,B32,B34,B45,B46,B54,B57,B62,B66,B8,C25,C30,C33,C5,C58,C65,D8
`Chr3:61735611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B42,B43,B55,C28
`Chr3:61735612`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A9,B111,B122,B123,B138,B139,B17,B32,B34,B45,B46,B54,B57,B62,B66,B8,C25,C30,C33,C5,C58,C65,D8
`Chr3:61735622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr3:61735646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:61735674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:61735679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:61735764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,B86,C38
`Chr3:61735772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A23,B123
`Chr3:61735782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:61735793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B27,B90,B92,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803766.1

308 aa

154

308

LRRNT_2

LRR_1

LRR_4

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 35-70 aa PF00560 LRR_1 147-169 aa PF00560 LRR_1 171-193 aa PF00560 LRR_1 244-266 aa PF12799 LRR_4 268-303 aa PF00560 LRR_1 269-290 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803766.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	35	70	3.5e-06	27.9	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057803766.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	147	169	2e-26	87.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057803766.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	171	193	2e-26	87.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057803766.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	244	266	2e-26	87.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057803766.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	268	303	1.6e-23	82.9	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057803766.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	269	290	2e-26	87.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947783.1
ATGGACAAAAAGCTTCATTGCATTTTTGCGTATGCATTCCTAATTACCATAACCTTCCAAATGCTTTCTTCTGAAGCCAAAGCTAAACAACCTCTGAGCCTTGCAACTGATCAAACTGCCCTTCTTTCACTCAAACATACATCTCTTTTACTTGCAACTAATTGGACCAACTCCACCTCCGTCTGCACCTGGATTGGCGTCACTTGCAGCTTGCGCCACCCAAGAGTAGCTGCCTTGAATCTCTCCAACATGGCTCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019100
ATGGACAAAAAGCTTCATTGCATTTTTGCGTATGCATTCCTAATTACCATAACCTTCCAAATGCTTTCTTCTGAAGCCAAAGCTAAACAACCTCTGAGCCTTGCAACTGATCAAACTGCCCTTCTTTCACTCAAACATACATCTCTTTTACTTGCAACTAATTGGACCAACTCCACCTCCGTCTGCACCTGGATTGGCGTCACTTGCAGCTTGCGCCACCCAAGAGTAGCTGCCTTGAATCTCTCCAACATGGCTCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803766.1
MDKKLHCIFAYAFLITITFQMLSSEAKAKQPLSLATDQTALLSLKHTSLLLATNWTNSTSVCTWIGVTCSLRHPRVAALNLSNMALSATIPPQLGHLSFLVFLDLSNNLFYGDLPHQLSLLRRLKFISFQLNNFTGDIPPMLGQLPKLEYLSLRNNSFIGSIPKSLSNLTNLQFLDLTSNSLSGEIPKEFGRLQSLQTLVVQLNHLSGAIPSAIFNISTLVSMAFTYNELSGSLPTDICSNLPSLTGIYLSYNQLSGAIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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