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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004362`

染色体: Chr03 坐标: 61845964-61846782 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004362`
名称	SmilChr03G004362
描述	receptor-like protein 43
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61845964 - 61846782 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019110`
GeneID	`131019110`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019110`
原始查询	`LOC131019110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 43
产物	receptor-like protein 43
Arabidopsis	`AT2G33060` (RLP27) receptor like protein 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817868] identity=44.7; qcov=0.658; evalue=2.04e-41; confidence=medium
Rice	`Os01g0162800` - identity=48.1; qcov=0.665; evalue=4.29e-41; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019110

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803776.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057803776.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803776.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803776.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803776.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61845996`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr3:61845996`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr3:61846020`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B18,C55
`Chr3:61846020`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B18,C55
`Chr3:61846207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr3:61846234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr3:61846266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr3:61846390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr3:61846432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:61846444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	55	A10,A13,A16,A2,A3,A6,B10,B106,B107,B109,B11,B113,B114,B125,B137,B140,B26,B27,B28,B41,B47,B50,B55,B6,B65,B66,B67,B73,B81,B86,B90,C14,C15,C16,C24,C29,C31,C32,C38,C4,C46,C48,C5,C51,C56,C57,C59,C6,C61,C62,C65,C73,C77,C78,D6
`Chr3:61846461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B90,D11
`Chr3:61846476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,C62,C8,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803776.1

272 aa

136

272

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF00560 LRR_1 71-91 aa PF13516 LRR_6 92-104 aa PF00560 LRR_1 93-114 aa PF00560 LRR_1 118-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803776.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	71	91	2.5e-15	54.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057803776.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	92	104	8.4e-06	26.2	Leucine Rich repeat
`XP_057803776.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	93	114	2.5e-15	54.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057803776.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	118	139	2.5e-15	54.0	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947793.1
ATGGATGTGAAAGAAAATCAAACAAATCCAACACCAAGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATCGCGCCTTGCTATATTATTTGGAGATGAGAAAAACAAATCTAACACCAAGTGATGATGATTGCACCTTTCTATATTATTTGGAGATGAGAATCACCTTGAAAGGTGTGAATCAATTATTGAAGAAGAGATTGTTGAAAACCTTTACAACTATTGACTTTTCCTCCAATAAATTCTCTGGGAGTATTCCAAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019110
ATGGATGTGAAAGAAAATCAAACAAATCCAACACCAAGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATCGCGCCTTGCTATATTATTTGGAGATGAGAAAAACAAATCTAACACCAAGTGATGATGATTGCACCTTTCTATATTATTTGGAGATGAGAATCACCTTGAAAGGTGTGAATCAATTATTGAAGAAGAGATTGTTGAAAACCTTTACAACTATTGACTTTTCCTCCAATAAATTCTCTGGGAGTATTCCAAATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803776.1
MDVKENQTNPTPSDDDDDDDDDRALLYYLEMRKTNLTPSDDDCTFLYYLEMRITLKGVNQLLKKRLLKTFTTIDFSSNKFSGSIPNSMGNLNSLRYLNLSHNNLMGHIPASLGNISVLESLDLSSNKLDGGIPSDLTRLTFLEKLNLSMNDLVGQIPQSNQFSTFENDSYIGNLRLCGVPLTRKCNEENGRQMQPEEEEEDEYGLIDGFGWRSVVMGYGNGLIVGIGIGCCIIRFGRPRWLVEFFFGVGYTYKKNKKKKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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