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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr03G004401

染色体: Chr03 坐标: 62201092-62202024 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr03G004401
名称SmilChr03G004401
描述LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO1
染色体 / SeqIDChr03 / NC_080389.1
坐标与链方向62201092 - 62202024 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131019133
GeneID131019133
locus_tag-
NCBI NameLOC131019133
原始查询LOC131019133

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO1
产物LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO1
ArabidopsisAT4G20140 (GSO1)
Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827760]
identity=39.8; qcov=0.932; evalue=4.45e-51; confidence=medium
RiceOs01g0694100 (LRR-RLK)
-
identity=40.9; qcov=0.977; evalue=8.93e-61; confidence=medium
GOGO:0005515 (protein binding)
KEGG-
PfamPF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF12799 (LRR_4); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131019133

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cell membrane 细胞膜 1.00000 XP_057803802.1
2 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057803802.1
3 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057803802.1
4 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057803802.1
5 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057803802.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803802.1
310 aa
N
1
155
310
LRRNT_2
LRR_1
LRR_8
LRR_1
LRR_14
LRR_1
LRR_1
LRR_8
LRR_6
LRR_4
LRR_8
LRR_1
LRR_1
C
PF08263 LRRNT_2 33-68 aa PF00560 LRR_1 98-117 aa PF13855 LRR_8 144-204 aa PF00560 LRR_1 145-167 aa PF23598 LRR_14 162-274 aa PF00560 LRR_1 169-191 aa PF00560 LRR_1 193-214 aa PF13855 LRR_8 193-253 aa PF13516 LRR_6 240-255 aa PF12799 LRR_4 241-277 aa PF13855 LRR_8 241-301 aa PF00560 LRR_1 243-264 aa PF00560 LRR_1 266-288 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057803802.1 Pfam PF08263 LRRNT_2 Family 33 68 2.1e-06 28.6 Leucine rich repeat N-terminal domain
XP_057803802.1 Pfam PF00560 LRR_1 Repeat 98 117 1.4e-29 96.4 Leucine Rich Repeat
XP_057803802.1 Pfam PF13855 LRR_8 Repeat 144 204 4.7e-26 91.0 Leucine rich repeat
XP_057803802.1 Pfam PF00560 LRR_1 Repeat 145 167 1.4e-29 96.4 Leucine Rich Repeat
XP_057803802.1 Pfam PF23598 LRR_14 Repeat 162 274 7.2e-21 75.0 Leucine-rich repeat region
XP_057803802.1 Pfam PF00560 LRR_1 Repeat 169 191 1.4e-29 96.4 Leucine Rich Repeat
XP_057803802.1 Pfam PF00560 LRR_1 Repeat 193 214 1.4e-29 96.4 Leucine Rich Repeat
XP_057803802.1 Pfam PF13855 LRR_8 Repeat 193 253 4.7e-26 91.0 Leucine rich repeat
XP_057803802.1 Pfam PF13516 LRR_6 Repeat 240 255 9.4e-08 32.3 Leucine Rich repeat
XP_057803802.1 Pfam PF12799 LRR_4 Repeat 241 277 9e-22 77.3 Leucine Rich repeats (2 copies)
XP_057803802.1 Pfam PF13855 LRR_8 Repeat 241 301 4.7e-26 91.0 Leucine rich repeat
XP_057803802.1 Pfam PF00560 LRR_1 Repeat 243 264 1.4e-29 96.4 Leucine Rich Repeat
XP_057803802.1 Pfam PF00560 LRR_1 Repeat 266 288 1.4e-29 96.4 Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057947819.1
ATGGACAAAAAGCTTTATTGCATTTTGCAGTATGCATTCCTAATCACCATAACCTTCCCAATGCTTTCTTCTGAAGCCAAACAACCTATGAGTCTTGCAACTGATCAAACTGCCCTTCTTTCACTCAAACATACATCTCTTTTACTTGCAACTAATTGGACCAATTCGAGCTCCGTCTGCAGCTGGATTGGCGTCACTTGCAGCTTGCGCCACCACAGAGTATCTGCCTTGAATCTCTCCAACATGGCTCTCTCCGGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131019133
ATGGACAAAAAGCTTTATTGCATTTTGCAGTATGCATTCCTAATCACCATAACCTTCCCAATGCTTTCTTCTGAAGCCAAACAACCTATGAGTCTTGCAACTGATCAAACTGCCCTTCTTTCACTCAAACATACATCTCTTTTACTTGCAACTAATTGGACCAATTCGAGCTCCGTCTGCAGCTGGATTGGCGTCACTTGCAGCTTGCGCCACCACAGAGTATCTGCCTTGAATCTCTCCAACATGGCTCTCTCCGGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057803802.1
MDKKLYCILQYAFLITITFPMLSSEAKQPMSLATDQTALLSLKHTSLLLATNWTNSSSVCSWIGVTCSLRHHRVSALNLSNMALSGTIPPQLGHLSFLVSLDLSNNHFYGDLPQELSLLRRLKFISFRLNNFTGDIPPMLGQLPKLEYLSLRNNSFIGSIPKSLSNLTNLQLLDLTSNSLSGEIPKELGRLQSLKTLYVQSNHLTGAIPSAIFNISTLVSMAFTDNELSGSLPTDMCRNLPTLTVLSLSDNQLSGTIPSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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