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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004443`

染色体: Chr03 坐标: 62561791-62572113 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004443`
名称	SmilChr03G004443
描述	D-amino-acid transaminase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62561791 - 62572113 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019138`
GeneID	`131019138`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019138`
原始查询	`LOC131019138`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	D-amino-acid transaminase, chloroplastic-like
产物	D-amino-acid transaminase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G57850` (ADCL) D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835895] identity=61.3; qcov=0.564; evalue=2.54e-43; confidence=medium
Rice	`Os02g0273100` - identity=66.7; qcov=0.574; evalue=9.94e-47; confidence=medium
GO	GO:0003824 (catalytic activity); GO:0019752 (carboxylic acid metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019138

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803807.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057803807.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803807.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803807.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803807.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62564281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr3:62571227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B46,B85,D7
`Chr3:62571240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr3:62571288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C45
`Chr3:62571300`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B35
`Chr3:62571300`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B35
`Chr3:62571854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B24,C26,C85
`Chr3:62571902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:62571907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr3:62571911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C47
`Chr3:62571913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,C83,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803807.1

188 aa

188

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 22-68 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 25-81 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803807.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	22	68	7.6e-15	55.5	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057803807.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	25	81	3.2e-16	60.0	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947824.1
CCTATTTTATTTTGAATTCTGGGACCGTTTTATTTCTCTCTCTCTCTCTCTAAACAAACAATTCAAGCACTCATTAACACCAAATGCAGTGAACTGAAGTAGATGATTATTGCTATTTTTGAGCTGTATTAGTATATAATTATTACTTTTTGAGCTGTGTTAGTGGATGATTATTGCTTTTGAACCTGCGTGAATTGAAGTGAAGACTCGAAAATTTGGTTTAGAATCTGTAAATGAGTGTCGAGCCGATCGGGTGACGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019138
ATGGTCTACAAGGAGCTCGACCTTCGCATGGGAGAAAAAAGTGGTCCCACAAGGCGTTCGACAAAAGGGCAATGGACAGCAGAAGAGGATGAAATTTTACGGATGGCTGTTCAACGCTTCAAAGGAAAAAACTGGAAAAAGATAGCCGAGTGTTTCAAGGATCGAGCAGATGTACAGTGCTTACACAGATGGCAAAAGGTTTTGAATCCAGAACTTGTCAAAGGTCCATGGTCAAAAGAGACAAAGGGGAAGGAATTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803807.1
MVYKELDLRMGEKSGPTRRSTKGQWTAEEDEILRMAVQRFKGKNWKKIAECFKDRADVQCLHRWQKVLNPELVKGPWSKETKGKEFVMPKFDKILRGCTARRVLVLAESLVEEGRLRGIRLRDVTVEEGKEADEMMLIGSGVLVRAVVQWDDQVIGDGNEGPVARSLRNLILEDMKLGPATVRVAVPY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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