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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001818`

染色体: Chr03 坐标: 24844864-24846175 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001818`
名称	SmilChr03G001818
描述	uncharacterized SmilChr03G001818
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	24844864 - 24846175 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019198`
GeneID	`131019198`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019198`
原始查询	`LOC131019198`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0480300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0480300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os09g0480300` - identity=32.1; qcov=0.662; evalue=2.25e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019198

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803855.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803855.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803855.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803855.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803855.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:24845371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B39,B91,D6,D7
`Chr3:24845382`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B39,B91,D6,D7
`Chr3:24845382`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B39,B91,D6,D7
`Chr3:24845402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B78
`Chr3:24845428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B74,B78,B95
`Chr3:24845451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B66
`Chr3:24845461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A1,A22,B1,B124,B129,B132,B2,B33,B39,B47,B50,B57,B60,B64,B69,B78,B85,B91,C24,C33,C34,C42,C6,C60,C63,C67,C82,D11,D6,D7
`Chr3:24845489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:24845505`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A1,A22,B1,B124,B129,B132,B2,B39,B47,B49,B50,B60,B64,B69,B78,B85,B91,C12,C24,C33,C34,C42,C6,C60,C63,C67,C82,D11,D6,D7
`Chr3:24845510`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	124	A1,A10,A13,A15,A2,A20,A21,A22,A25,A3,A4,A6,B1,B100,B103,B105,B107,B11,B110,B111,B114,B117,B119,B123,B124,B126,B128,B129,B131,B132,B134,B135,B137,B15,B16,B19,B2,B20,B24,B29,B30,B31,B32,B33,B36,B39,B45,B47,B48,B49,B5,B50,B54,B57,B60,B64,B65,B66,B69,B7,B70,B71,B73,B74,B76,B78,B79,B8,B81,B83,B85,B86,B87,B89,B91,B97,B98,B99,C11,C12,C13,C14,C15,C17,C21,C23,C24,C28,C30,C31,C33,C34,C35,C42,C47,C49,C5,C50,C53,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C67,C69,C7,C70,C75,C76,C77,C78,C82,C83,C85,D11,D5,D6,D7,D9
`Chr3:24845519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,D10,D7
`Chr3:24845522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947872.1
TCTAGTTCATTTGTCATGGTTCTGATACTATTCATAATCTGTGCAACTTTGTAGAGAACTGCAGCTTGTTTAAATCAAGAAAGCTGTGTTTGTTTTGATTTTCAATTTTATCTTAAAATCACAGGGATTGGAGAAAGTTGTGGCTGCTCTGACACCTTTTGCAGAGCATAGAAATTGTGCACTTCACGTGTACATGAACTGGAAGAAGGAGCATAAGGGTGCAACTTTGAAAATTTTCTTTTGGAGGGCTGTTAGAAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019198
ATGCATGTGGTGGCTGCCATTCATTTCATGAATCATGATCCAGTTCACTACGTGCATCAATATTATTCTGTCGAGAAATATTTGCTAGGATATCAATGTGGACTAGAACCTGTTAGAGGGGAAAAAATGTGGCCAGAGGTTTCTGGATTTAAGGTGAAGCCACCTATGATCTTAAAAAAAGCTGGAAGGCCCAAAAAGAAAAGAATTAGGGGCATTGCTGAACGAGATCCAGCAAATCCGAATAAGTTGAAGAAGGATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803855.1
MHVVAAIHFMNHDPVHYVHQYYSVEKYLLGYQCGLEPVRGEKMWPEVSGFKVKPPMILKKAGRPKKKRIRGIAERDPANPNKLKKDGMQMACKNCGGVGHNKRPCKVDRVELPTKEKGKRGQSAKQNPPVAAASTSMGKSRKTPQASEASTIAKERNFAR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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