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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001621`

染色体: Chr01 坐标: 30304066-30306280 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001621`
名称	SmilChr01G001621
描述	uncharacterized SmilChr01G001621
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30304066 - 30306280 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019290`
GeneID	`131019290`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019290`
原始查询	`LOC131019290`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818200]; symbol=AT2G36290; hit=AT2G36290; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818200]; symbol=AT2G36290; hit=AT2G36290; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G36290` (AT2G36290) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818200] identity=55.9; qcov=0.98; evalue=2.12e-141; confidence=high
Rice	`Os02g0532300` (P0605D08.22-2) - identity=55.4; qcov=0.936; evalue=7.72e-133; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019290

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057803864.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057803864.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057803864.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057803864.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803864.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30304362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B99,C15,D9
`Chr1:30304366`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B74
`Chr1:30304366`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B74
`Chr1:30304390`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B106
`Chr1:30304390`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B106
`Chr1:30304393`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B106
`Chr1:30304393`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B106
`Chr1:30304419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C33
`Chr1:30304579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:30304617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:30304620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,A16,B139
`Chr1:30304635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803864.1

345 aa

172

345

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

Abhydrolase_1

PF12146 Hydrolase_4 62-320 aa PF12697 Abhydrolase_6 66-321 aa PF00561 Abhydrolase_1 66-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803864.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	62	320	1e-11	45.4	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057803864.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	66	321	8.9e-13	50.1	Alpha/beta hydrolase family
`XP_057803864.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	66	322	3e-13	50.7	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947881.1
TATAGTCCTACCAACCGAATTTGGGTCGTCACTTTCAAGTAGTAGGCGTTTAACATTTCAACTTCCACACTTCAAAAACCAACCTCCAATTCTCTCTGCACACACACACACACACACTGCATTTGCAGAAGCAATCTACAGAAAGCCATGTCTTGGAAAATGAGAGTGGTGTTGTTGATGGGTTTGGTGGCATGGGGTTACCGGGCATTCCGGCCTCCAGCGCCCCGCCTCTGTGGCACGAGGGGCGGGCCGCCCCTCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019290
ATGTCTTGGAAAATGAGAGTGGTGTTGTTGATGGGTTTGGTGGCATGGGGTTACCGGGCATTCCGGCCTCCAGCGCCCCGCCTCTGTGGCACGAGGGGCGGGCCGCCCCTCGTAGGTCCTAGAATCAAACTTAGGGATGGAAGGCACCTATCATACAAGGAACATGGAGTCCCCAAAGAGGCAGCCAAATACAAGGTCATCTTGGTTCATGGCTTTAGCTCTAGCAAACACGAAGCCTCCATCACTGCAACGGAAATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803864.1
MSWKMRVVLLMGLVAWGYRAFRPPAPRLCGTRGGPPLVGPRIKLRDGRHLSYKEHGVPKEAAKYKVILVHGFSSSKHEASITATEMVEKLGIYFVSFDRPGYGESDPNPKRTIQSLAFDIEELGDQLELGPKFYIIGTSMGGQAVWGCLKYIPHRLAGAALLAPVVNYWWPSFPRALARDAYALQPVQDQWALRVARYAPWLVYWWNTQKWFPGSSVAAGTQNLTVPDLEIVARMVASGVSHKAYATQQGVHESYHRDMM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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