当前解析结果
SmilChr01G001601| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001601 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001601 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001601 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 30183154 - 30186704 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131019349 |
|---|---|
| GeneID | 131019349 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019349 |
| 原始查询 | LOC131019349 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019349 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803868.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803868.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803868.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803868.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057803868.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:30185262 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B10,B104,B57,B84 |
Chr1:30185284 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B10,B57,B84 |
Chr1:30185428 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B26,B8,C83 |
Chr1:30185445 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C43 |
Chr1:30185454 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B101,B26,B8 |
Chr1:30185454 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B26,B8 |
Chr1:30185464 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B79,C62,D1 |
Chr1:30185476 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B71 |
Chr1:30185482 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:30185496 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 122 | A10,A13,A14,A16,A18,A19,A22,A24,A5,A6,A7,B102,B104,B105,B107,B108,B109,B110,B112,B113,B114,B117,B118,B12,B120,B121,B122,B125,B126,B128,B129,B13,B131,B137,B138,B16,B2,B22,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B33,B35,B37,B38,B39,B4,B44,B46,B47,B48,B49,B53,B55,B58,B6,B60,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B7,B70,B75,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,C10,C12,C2,C20,C22,C23,C24,C26,C29,C30,C32,C35,C36,C38,C39,C42,C43,C45,C46,C51,C54,C56,C59,C6,C64,C66,C67,C68,C81,C85,C9,D1,D11,D4,D5,D6,D7 |
Chr1:30185500 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C19 |
Chr1:30185532 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A6,B84,B98,C82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。