Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001310`

染色体: Chr04 坐标: 20958065-20959967 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001310`
名称	SmilChr04G001310
描述	uncharacterized SmilChr04G001310
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	20958065 - 20959967 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019364`
GeneID	`131019364`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019364`
原始查询	`LOC131019364`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019364

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803880.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803880.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803880.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803880.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803880.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:20958177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr4:20958194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B139,B72,B99
`Chr4:20958210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr4:20958220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B72,B99
`Chr4:20958229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B31,B65,C36,C75
`Chr4:20958264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr4:20958280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr4:20958321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr4:20958337`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	B130,B136,B20,B40,B59,B89,C33,C38,C48,C58,C62,D4
`Chr4:20958427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C53
`Chr4:20958481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:20958618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947897.1
TTCACGCCATTCCTTTCTGAGATGAAATCAATGGCGAGATTTTCTGGGTTTCTGGTGAATCTTATAGCTGAACAGAAGATTAGAATTGAGAAATATACTGAACAATTCTTACGAGCAAGGGTTTCAAATTCATCATTGCGATCGAAAAAATCCCAAGAGTTCAATTCATCCCCCGACTGCATCAAGATATGGAAACATCTAGCGGCAATGCAATCGTTGTGCCAGATTCTCCAAGTGATTCATCCATTTCACCAGACAAG...

XM_057947898.1
TTCACGCCATTCCTTTCTGAGATGAAATCAATGGCGAGATTTTCTGGGTTTCTGGTGAATCTTATAGCTGAACAGAAGATTAGAATTGAGAAATATACTGAACAATTCTTACGAGCAAGGGTTTCAAATTCATCATTGCGATCGAAAAAATCCCAAGAGTTCAATTCATCCCCCGACTGCATCAAGGTAAATCCATCAATTTGTTGAGGTATAATACTTCCATTTTTTGAAATTTAGTTTGTGTAATTCATTAAACCTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019364
ATGTCGTATATATCACGGCAGAGAGCCTTTTTTGGTGCATTGGATCGTGAGTTGCAACTATATCAGACAAATGATATCGGCTATATTGACATGTTTATTTTCCCTGTTTTCCCCGATGATCAGCCTTATATTGTTTGTTTTGACCTGCGGAAAGAGTTGATTTTCATAATAGACTCTTCTATTGAGGTTAACAAACATCCGGTTAGCTCCAACTACAACATTTTGTGTGATATCCTGAGATCACTACCGTCGGAGTTTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057803880.1
MSYISRQRAFFGALDRELQLYQTNDIGYIDMFIFPVFPDDQPYIVCFDLRKELIFIIDSSIEVNKHPVSSNYNILCDILRSLPSEFLNSNREDLSSTSVAKSTIEGVDLKWADSMNTIDVVLYVMRHMETFGGDTSVNWNTRLLNATHHHLGILRMRYCAPIASWEHNKYKDDVLRDSAATYGAVIAVNSTRFNRVLAG

XP_057803881.1
MSYISRQRAFFGALDRELQLYQTNDIGYIDMFIFPVFPDDQPYIVCFDLRKELIFIIDSSIEVNKHPVSSNYNILCDILRSLPSEFLNSNREDLSSTSVAKSTIEGVDLKWADSMNTIDVVLYVMRHMETFGGDTSVNWNTRLLNATHHHLGILRMRYCAPIASWEHNKYKDDVLRDSAATYGAVIAVNSTRFNRVLAG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器