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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001332`

染色体: Chr04 坐标: 21517840-21523385 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001332`
名称	SmilChr04G001332
描述	kinetochore protein NDC80 homolog
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	21517840 - 21523385 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019383`
GeneID	`131019383`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019383`
原始查询	`LOC131019383`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	kinetochore protein NDC80 homolog
产物	kinetochore protein NDC80 homolog
Arabidopsis	`AT3G54630` (AT3G54630) kinetochore protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824628] identity=42.3; qcov=0.937; evalue=4.15e-140; confidence=medium
Rice	`Os08g0468400` - identity=40; qcov=1; evalue=4.97e-120; confidence=medium
GO	GO:0031262 (Ndc80 complex); GO:0051315 (attachment of mitotic spindle microtubules to kinetochore)
KEGG	-
Pfam	PF03801 (Ndc80_HEC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019383

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803910.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057803910.1`
3	Centromere	着丝粒	0.60000	`XP_057803910.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803910.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803910.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:21517939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr4:21517974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C19
`Chr4:21518540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr4:21518541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B133,B37,C16,C27
`Chr4:21518591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C42
`Chr4:21518716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C15
`Chr4:21518727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr4:21518903`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B36
`Chr4:21518903`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B36
`Chr4:21518953`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B16
`Chr4:21518953`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B16
`Chr4:21518971`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803910.1

573 aa

286

573

Ndc80_HEC

PF03801 Ndc80_HEC 72-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803910.1`	Pfam	`PF03801`	Ndc80_HEC	Domain	72	172	4.6e-18	65.9	HEC/Ndc80p family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947927.1
AAACAAAGCCCAAAACATTTTAAAACAGTCGCTCATAAGGCGGGAAACCAACATCTGAAGCCGAACCAATCCACTACGATGCGAGCTCCCGGCCGCCGCCGCCCGGCGGAATCCCTTGCCCCGGACCGGCGTCCGCCACCTCCCACGCCCACCAACACCGCCGATCCGTGGCAGTTCATCTCCACCCCCCTCCACGGCCGCGAATCTGACGCCAGTTTCTGCAGCAGCCGCCCCTCCACTGCCTCCACCGGTCGCCCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019383
ATGCGAGCTCCCGGCCGCCGCCGCCCGGCGGAATCCCTTGCCCCGGACCGGCGTCCGCCACCTCCCACGCCCACCAACACCGCCGATCCGTGGCAGTTCATCTCCACCCCCCTCCACGGCCGCGAATCTGACGCCAGTTTCTGCAGCAGCCGCCCCTCCACTGCCTCCACCGGTCGCCCTTCCGCCGCCATCACCAACATCTCCGACCGATCGTACCAACTCGCCGCCCTCCGCACCATCAATTCCTACCTCACCTCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803910.1
MRAPGRRRPAESLAPDRRPPPPTPTNTADPWQFISTPLHGRESDASFCSSRPSTASTGRPSAAITNISDRSYQLAALRTINSYLTSQSAPFSLKHPLPSAKDITETLKLLLQRLGFASQKIDDDLSHALKFLKCPLKLNKSALRAPGTPHSWPNLLAVIHWLVQLAQYIDSTMNLSPELEGDKMLMHNIQSYLLYIGGEDEAMDALDSECIRELEEWRDKVGENATAVDFNASELDAKLMALKKGPSQKEVLEQEKAVVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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