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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001368`

染色体: Chr04 坐标: 22206901-22214303 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001368`
名称	SmilChr04G001368
描述	uncharacterized SmilChr04G001368
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22206901 - 22214303 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019413`
GeneID	`131019413`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019413`
原始查询	`LOC131019413`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA modification 11 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822245]; symbol=TRM11; hit=AT3G26410; species=arabidopsis; confidence=high
产物	tRNA modification 11 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822245]; symbol=TRM11; hit=AT3G26410; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G26410` (TRM11) tRNA modification 11 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822245] identity=71.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0556400` - identity=69.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004809 (GO:0004809); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0032259 (methylation)
KEGG	-
Pfam	PF01170 (UPF0020); PF25904 (Tmrp11_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019413

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803940.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057803940.1`
3	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057803940.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.40000	`XP_057803940.1`
5	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057803940.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22207529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr4:22207597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B119,B53,C42
`Chr4:22207655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr4:22207665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr4:22208269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr4:22208362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr4:22208417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B35
`Chr4:22208509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr4:22209141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B33,B40
`Chr4:22213661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr4:22213694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr4:22213773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B59,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803940.1

470 aa

235

470

Tmrp11_N

UPF0020

PF25904 Tmrp11_N 2-182 aa PF01170 UPF0020 192-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803940.1`	Pfam	`PF25904`	Tmrp11_N	Domain	2	182	1.6e-30	106.6	Tmrp11 THUMP N-terminal domain
`XP_057803940.1`	Pfam	`PF01170`	UPF0020	Domain	192	314	1.4e-14	55.0	RMKL-like, methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947957.1
ACCTAAAAAAGAGAAAAAGAAAAAGAAAGAAACAAGGAAGAATTTCAAGGGTTTTGGGTCGGGGGTTTTACCAATTCTGGAGCGGAAGCTCTTCTCACCAACTTCCAACTCCTGCGCCGTCGTGCCTCCCCCGCCAACAAATTCAGATTCTCACGCTCCCCGCAAAAGTGATAGCATTCAGCTTCATCGAAGCATTTCCCCTCCAATAAAAGATCAAACGTCATGTGGTATCTATGCGTCTTCTACCACAGGTTGTTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019413
ATGTGGTATCTATGCGTCTTCTACCACAGGTTGTTGGAATACAGGAAAGCCGAGTTCGAGTCCCTCGCCGGACTTTTTGAGGGCCGCAGCGGCGCTACCCGTCTCCAATGGCGGCTGCCGGAGGACCACCACCCGGATTCACCGTTTCATTTCGTCGATCTTGCGTCCGAAGAGACGGCCCGATTCATTGCCAATCGAAGTATTCTTGTGAAGGGCATATACGAAGTTTGGGGCGAAGGAAGAAATTTTGAGGAACTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803940.1
MWYLCVFYHRLLEYRKAEFESLAGLFEGRSGATRLQWRLPEDHHPDSPFHFVDLASEETARFIANRSILVKGIYEVWGEGRNFEELEEAVRSYPDEQKTLYLTPGSTFRITVESFGKAISFHEQSERIEKLAFVPFQGRVNLRNPDHKFCLIDNDDYGDKNGLPPASQRRIFFGREVGASDRKILQTYQLKSRKYLGPTAMDAEIAFLMANQAQVKPGKLVYDPFVGTGSILIAAAHFGAMTMGADIDIRVVRDGRGPDC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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