当前解析结果
SmilChr04G001383| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001383 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001383 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001383 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 22484790 - 22487170 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131019424 |
|---|---|
| GeneID | 131019424 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019424 |
| 原始查询 | LOC131019424 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019424 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057803949.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057803949.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803949.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803949.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803949.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:22485192 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 33 | A18,A22,A25,B107,B122,B124,B127,B136,B19,B21,B25,B41,B46,B50,B53,B54,B58,B67,B70,B73,B87,C11,C12,C16,C38,C43,C44,C66,C69,C79,D3,D8,D9 |
Chr4:22485215 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B121,C80 |
Chr4:22485222 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B111,B83,C32,C51,C56 |
Chr4:22485226 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 15 | A11,B125,B132,B16,B28,B36,B40,B65,B78,B9,B91,C16,C19,C25,C84 |
Chr4:22485230 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B22,C86,D4 |
Chr4:22485231 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C51 |
Chr4:22486800 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B29,C87 |
Chr4:22486805 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B31 |
Chr4:22486813 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B113,B131,B89 |
Chr4:22486825 |
GGA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 18 | B102,B127,B134,B139,B14,B15,B23,B50,B54,B55,C16,C20,C5,C69,C75,C78,C85,D10 |
Chr4:22486826 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 18 | A16,B106,B125,B2,B29,B41,B53,B56,B77,B85,B91,C10,C41,C49,C8,C87,D10,D2 |
Chr4:22486849 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B31 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。