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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001386`

染色体: Chr04 坐标: 22531747-22533907 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001386`
名称	SmilChr04G001386
描述	uncharacterized SmilChr04G001386
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22531747 - 22533907 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019427`
GeneID	`131019427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019427`
原始查询	`LOC131019427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsC3H39; symbol=OsC3H39; hit=Os05g0576300; species=rice; confidence=weak
产物	OsC3H39; symbol=OsC3H39; hit=Os05g0576300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G32360` (AT1G32360) Zinc finger (CCCH-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840128] identity=40.7; qcov=0.19; evalue=2.26e-06; confidence=weak
Rice	`Os05g0576300` (OsC3H39) - identity=46.5; qcov=0.139; evalue=1.93e-06; confidence=weak
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00642 (zf-CCCH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803951.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803951.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057803951.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057803951.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057803951.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22532067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:22532179`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A5,B29
`Chr4:22532179`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A5,B29
`Chr4:22532216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B124,B64,B79
`Chr4:22532242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:22532262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B41,B50
`Chr4:22532755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C56
`Chr4:22532759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B41,B50
`Chr4:22532766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B33,B40,C81
`Chr4:22533042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:22533108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B25,C18,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803951.1

310 aa

155

310

zf-CCCH

PF00642 zf-CCCH 144-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803951.1`	Pfam	`PF00642`	zf-CCCH	Family	144	170	2.9e-08	34.1	Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947968.1
GGGAAGCATATTCCATTCCTCTCTTTCACACGGACAATTGTATTATACGAATGAAAAATGTTCTTGCATTTACTGCTACCCCTCCGCCCTCGCTACTATAAATGCGTTTCAACTTCCTTAACTTTTCAAAATTGCAGTCGGAAATATTTCTCGTTCAAATATGCGCAGGAAAGCGAAGCGAAGCTGAGCTTCGCTTAAAATTCAGATTTCATCTTCATTTCTCGGATTCTTCTTCGATCGATCAAGGCGTTACCACGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019427
ATGCATACGATGTTCTTGGAAAATAAGCGCGAAACCGAAGGTCCGAAGTTACAATCCGGCTTCGTGTCACCAATCAACTTGATGAGTGTGGCAGGCAGCCGCCGCTCTAGGTCAGTGTTTGATCCGTACGCATCCGACAGTTCGGATTCCCCGTCTCCGCTGATGAAGTTCCTGCGCTCTGTTGATCCGGCGGCCGGAGGTGCCTCCTCGCCGGGATTCGTCACACCGGTCAAGGTCGAGGAAGATGTGATTGTCATGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803951.1
MHTMFLENKRETEGPKLQSGFVSPINLMSVAGSRRSRSVFDPYASDSSDSPSPLMKFLRSVDPAAGGASSPGFVTPVKVEEDVIVMDGISVPKSNKGSGEVRLRLPLMSSNSVNCSYGKSNSTGSSSSSGSGGRRSGVENSKSYKNRVCHFWETSGICQFGSECQFAHGKEELRHHRWFPGKIKLEISKLNSSIEGSSPSPTPSPHGSKFLRNSQVKAAAAAGEEAFSLPSLSSLSPIPAKLVSGTSAIPNTALLISEWT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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