Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001390`

染色体: Chr04 坐标: 22601127-22602015 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001390`
名称	SmilChr04G001390
描述	uncharacterized SmilChr04G001390
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22601127 - 22602015 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019432`
GeneID	`131019432`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019432`
原始查询	`LOC131019432`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019432

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803955.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057803955.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803955.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803955.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803955.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22601303`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B69,C35,C5
`Chr4:22601303`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B69,C35,C5
`Chr4:22601306`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	A6,B120,B131,B14,B140,B17,B19,B22,B25,B45,B52,B54,B70,B73,B93,B95,C14,C24,C58,C68,C7,C73,C82,C84,C85
`Chr4:22601327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B85,B88,C29
`Chr4:22601660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B131
`Chr4:22601662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr4:22601665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A13,A4,B10,B100,B109,B135,B138,B46,B69,B8,B85,C55,C82,D9
`Chr4:22601666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B5,B50,B52,B84,C79
`Chr4:22601667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,C11,D8
`Chr4:22601672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr4:22601677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A13,B106,B21,B31,B61,B92,C11,C13,C23,C47,C60,C61
`Chr4:22601680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,C11,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947972.1
ATATGCTAAACCCTAATCAGTGTCTCCTATTTCCTAATTCCTCATTCCTAATCTGCGCCGCACAGCTTGAAGCCAAGAAGCCCCCAATCTCCAAGCCTGCATCCACCCGTCGCCGACTCGTCGCTGCCCCACCCGTCTCCCCCAACACCGCGGTGCCTCTGCTGTTCTGCGCGCTGCTGCTGCTGCATCTGATCTGCACCGGTAGCCGCGCCTGCTCCAGAGCCTGCATCGCCGCCTGCATCTGCACCGCGCCGCCCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019432
ATGCTAAACCCTAATCAGTGTCTCCTATTTCCTAATTCCTCATTCCTAATCTGCGCCGCACAGCTTGAAGCCAAGAAGCCCCCAATCTCCAAGCCTGCATCCACCCGTCGCCGACTCGTCGCTGCCCCACCCGTCTCCCCCAACACCGCGGTGCCTCTGCTGTTCTGCGCGCTGCTGCTGCTGCATCTGATCTGCACCGGTAGCCGCGCCTGCTCCAGAGCCTGCATCGCCGCCTGCATCTGCACCGCGCCGCCCCACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803955.1
MLNPNQCLLFPNSSFLICAAQLEAKKPPISKPASTRRRLVAAPPVSPNTAVPLLFCALLLLHLICTGSRACSRACIAACICTAPPHPSGRRSARRLLQSLHSVAAPPAPCRPQICSQPRIQLSYKLGGRLNA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器