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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001400`

染色体: Chr04 坐标: 22778149-22785839 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001400`
名称	SmilChr04G001400
描述	probable protein phosphatase 2C 62
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22778149 - 22785839 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019438`
GeneID	`131019438`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019438`
原始查询	`LOC131019438`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 62
产物	probable protein phosphatase 2C 62
Arabidopsis	`AT4G33500` (AT4G33500) Protein phosphatase 2C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829488] identity=53.9; qcov=0.066; evalue=3.44e-11; confidence=weak
Rice	`Os03g0192500` (OsBIPP2C1) - identity=70; qcov=0.064; evalue=6.84e-17; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019438

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057803967.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057803968.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057803967.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057803968.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803967.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22778948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B22,B58,B66
`Chr4:22779515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,C43,C70,C86,D11
`Chr4:22779549`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B93
`Chr4:22779549`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B93
`Chr4:22779930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,D4
`Chr4:22779931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,C57
`Chr4:22780011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B104,D10
`Chr4:22780212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B124,B64,B79,D11
`Chr4:22780214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr4:22780964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B24,C39,C75,C82
`Chr4:22783043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr4:22783044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803967.1

982 aa

491

982

PP2C

PF00481 PP2C 893-944 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803967.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	893	944	1.2e-10	42.3	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947984.1
ACATAGAAAATCTCAAGTTTTTTCAATATTCCCTCTTGGCTGCTTGTTTTGTCCTCCACAAATGGAGGTTGAGAGTTGAGTTTCCCACCAATTTTTATCCACTTTCTAACTCAACACAGTCACAAATGCATCAAAATTAAAATTCATGTAGTCTTAGATTGAGTGTGAGCAGAGCCTAGCAGTAATGGCTGATCTCTTGTGCAGTTTCTTGCCTTTGTTTTTGCCTCCAAAACGATATTCCTCTTCTGCGCTTCACTCCC...

XM_057947985.1
AATCTCAAGTTTTTTCAATATTCCCTCTTGGCTGCTTGTTTTGTCCTCCACAAATGGAGGTTGAGAGTTGAGTTTCCCACCAATTTTTATCCACTTTCTAACTCAACACAGTCACAAATGCATCAAAATTAAAATTCATGTAGTCTTAGATTGAGTGTGAGCAGAGCCTAGCAGTAATGGCTGATCTCTTGTGCAGTTTCTTGCCTTTGTTTTTGCCTCCAAAACGATATTCCTCTTCTGCGCTTCACTCCCTCAATTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019438
ATGGCTGATCTCTTGTGCAGTTTCTTGCCTTTGTTTTTGCCTCCAAAACGATATTCCTCTTCTGCGCTTCACTCCCTCAATTCAAGGCGTCCACTTCATCTTCCGCTGCTCTTCAAGCATTCTCCATTTGCGGCTTCTGCTTCTCCTTCCGACGTTGTTGTTATTTCAACTCACGAGCATTCCGATGGTAGCTTCTTGTTCCGGTTTGGGGACCCAAGTGAGGTTGTGAAAAATGTGGAAATGGAAGAAGCCAAGATTGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057803967.1
MADLLCSFLPLFLPPKRYSSSALHSLNSRRPLHLPLLFKHSPFAASASPSDVVVISTHEHSDGSFLFRFGDPSEVVKNVEMEEAKIVKEEIEGEEESNGSSMVEVLEGQDESKATASGLIEDSDHADSIVSSSNTLITVEGESEFSEKYKDEEFKDLSPDLDVERIGIDEEYKDLSPVEASIPDESLVEVFDEESLEETSKVTCMSKETEITSFHGVEECLNQEVVDSPADASILDQTLEVLDNVTTVGLLEKESDNISS...

XP_057803968.1
MADLLCSFLPLFLPPKRYSSSALHSLNSRRPLHLPLLFKHSPFAASASPSDVVVISTHEHSDGSFLFRFGDPSEVVKNVEMEEAKIVKEEIEGEEESNGSSMVEVLEGQDESKATASGLIEDSDHADSIVSSSNTLITVEGESEFSEKYKDEEFKDLSPDLDVERIGIDEEYKDLSPVEASIPDESLVEVFDEESLEETSKVTCMSKETEITSFHGVEECLNQEVVDSPADASILDQTLEVLDNVTTVGLLEKESDNISS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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