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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001402`

染色体: Chr04 坐标: 22830409-22832070 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001402`
名称	SmilChr04G001402
描述	uncharacterized SmilChr04G001402
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22830409 - 22832070 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019440`
GeneID	`131019440`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019440`
原始查询	`LOC131019440`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hyccin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836530]; symbol=AT5G64090; hit=AT5G64090; species=arabidopsis; confidence=high
产物	hyccin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836530]; symbol=AT5G64090; hit=AT5G64090; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G64090` (AT5G64090) hyccin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836530] identity=60.9; qcov=0.93; evalue=1.38e-154; confidence=high
Rice	`Os11g0169600` - identity=50.1; qcov=0.977; evalue=4.72e-103; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0046854 (phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process); GO:0072659 (protein localization to plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF09790 (Hyccin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019440

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803970.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803970.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803970.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803970.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803970.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22830589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr4:22830657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C42,C69
`Chr4:22830775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr4:22830963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B58
`Chr4:22830987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B24,C39,C75,C82
`Chr4:22831029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:22831155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B65,B84
`Chr4:22831263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B58,B59,B63,C85
`Chr4:22831378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C48
`Chr4:22831435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr4:22831436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:22831497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B120,B30,C16,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803970.1

431 aa

216

431

Hyccin

PF09790 Hyccin 77-389 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803970.1`	Pfam	`PF09790`	Hyccin	Repeat	77	389	1.5e-62	212.2	Hyccin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947987.1
CCACACATTGTTTCTTTTTAAATAAATTCAAAGACAATAATGCGCAGGGCAATTCGGTCAAGTAAATAGTGGAAGTAAACGGTAGTCATAATAAGTGAGAAAATAAGTTTTAACATAATTTCCTCCGGAGTCGGCGGAGCCTTCTCCATTTCCACCACCACCACCATGGACTTCCATCTCCACGGCGGCTCCCCCTCCTCCACCTCCTCTTCCTCCTCCCACCACCGCCACCCCAACAATAGTAACAACTCCGCCCCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019440
ATGGACTTCCATCTCCACGGCGGCTCCCCCTCCTCCACCTCCTCTTCCTCCTCCCACCACCGCCACCCCAACAATAGTAACAACTCCGCCCCCAACGGCCACTCCTCCGATCCTATGCACTCCTGGTGGGAGTCCATCTCCAGAGCCCGCTCCCGCATCCACCTCCTCTCCTCCCTCCTCCCCTCCTCCGCCGCCACCTCCGACGAAGACCCTCTCTCATCCCTCGCCGACACCGACCGCCCCGCCCGCTCCCTCCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803970.1
MDFHLHGGSPSSTSSSSSHHRHPNNSNNSAPNGHSSDPMHSWWESISRARSRIHLLSSLLPSSAATSDEDPLSSLADTDRPARSLLLSSAAYSSLSSALSAASSGSADDPLCHWLYDTYLSSDPDLRLVVLSALPLIASVYLHRIHHPDSDAPSSLSGFEAVLLALYTSETKARNGKAVTVSIPDLSQPSLYHAPRNPNKSSTPDSNPRPSIGVLSPPLEPQMAVKSTKRACIVGVALDCYYKQISQMPSWSKLDFCKFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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