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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001406`

染色体: Chr04 坐标: 22884763-22888039 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001406`
名称	SmilChr04G001406
描述	calmodulin-binding receptor-like cytoplasmic kinase 3
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22884763 - 22888039 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019443`
GeneID	`131019443`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019443`
原始查询	`LOC131019443`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calmodulin-binding receptor-like cytoplasmic kinase 3
产物	calmodulin-binding receptor-like cytoplasmic kinase 3
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os09g0123300` (OsRLCK259) - identity=29.1; qcov=0.784; evalue=9.38e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019443

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803973.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057803973.1`
3	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.40000	`XP_057803973.1`
4	Acrosome	Acrosome	0.40000	`XP_057803973.1`
5	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057803972.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22886272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,C56,C65,C76
`Chr4:22886283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,C65
`Chr4:22886331`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	58	A11,A14,A16,A18,A19,A2,A25,A5,A7,B109,B11,B110,B115,B12,B121,B126,B13,B132,B134,B137,B138,B18,B20,B30,B32,B41,B42,B43,B55,B60,B62,B64,B7,B72,B73,B79,B86,B88,B89,B91,B93,B99,C11,C16,C2,C3,C34,C38,C41,C51,C52,C53,C54,C6,C69,C73,D11,D6
`Chr4:22886338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,C74
`Chr4:22886349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B36
`Chr4:22886381`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B19,B95
`Chr4:22886381`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B19,B95
`Chr4:22886383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B95
`Chr4:22886428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B131,B2,B56,B7,B96,C14,C2,C61,C71,D8
`Chr4:22886440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B101
`Chr4:22886440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr4:22886629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B71,B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947989.1
AAAAAAATAGATTTTATTTAGGAAATTTAGAAACTAGAAGCCCTAGTTTTCTTCGTCTCTCACATCTAATCTCCCTGCCTCCTCCTGCCTCCTCCCTGTCTCTCTCGACTCTCTCTCTCCCCTCTCGACTCCGCCGCCGGCGCCGCTGCCCCGCGCCGGCCCGTCGCCGCCCACCCTTGTCGCTGCGTCGCGCCGCTGCCGCCCACCCTCGTCTCCCTCTTAATCTCATCTCTCTCTGACTCAAATGCACGCACACCACA...

XM_057947990.1
AAAATAGATTTTATTTAGGAAATTTAGAAACTAGAAGCCCTAGTTTTCTTCGTCTCTCACATCTAATCTCCCTGCCTCCTCCTGCCTCCTCCCTGTCTCTCTCGACTCTCTCTCTCCCCTCTCGACTCCGCCGCCGGCGCCGCTGCCCCGCGCCGGCCCGTCGCCGCCCACCCTTGTCGCTGCGTCGCGCCGCTGCCGCCCACCCTCGTCTCCCTCTTAATCTCATCTCTCTCTGACTCAAATGCACGCACACCACACCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019443
ATGGGTCTGGTTTTGCTAACATTGTGCTTGCTTGTGGAATCTACGGTAACAGCTGCCTCTGGCTTGTTGGAGCATCAAACGGCTTGTGGAAAGTACCATATTAGTAACTCGGATGATCCTAGCCATGAACTCTTTTATATTGATGGAAAATTGGTACATAGGTATTTCTTCTGTAAGGCTATGCGCGACTATCACGAGAGACAATGCTTTGTTCAGGAAAATATCAGAAATAAGTATTGCCAGTCATTAGAGAAATTGTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057803972.1
MGLVLLTLCLLVESTVTAASGLLEHQTACGKYHISNSDDPSHELFYIDGKLVHRYFFCKAMRDYHERQCFVQENIRNKYCQSLEKLSLLSGRKSLHDVVRDRYSEIDNDKTTLGGKDKYDNPVLKPKMLAMALPAFFLLCCTLVCPCFQAKKKDTSHTVLSKEPNSSELHHQFHSDVCIFLFVCFFFM

XP_057803973.1
MGLVLLTLCLLVESTVTAASGLLEHQTACGKYHISNSDDPSHELFYIDGKLVHRYFFCKAMRDYHERQCFVQENIRNKYCQSLEKLSLLSGRKSLHDVVRDRYSEIDNDKTTLGGKDKYDNPVLKPKMLAMALPAFFLLCCTLVCPCFQAKKKDTSHTVLSKEPNSIHYCD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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