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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001611`

染色体: Chr01 坐标: 30255606-30256762 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001611`
名称	SmilChr01G001611
描述	iron-sulfur assembly protein IscA-like 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30255606 - 30256762 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019451`
GeneID	`131019451`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019451`
原始查询	`LOC131019451`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	iron-sulfur assembly protein IscA-like 1, mitochondrial
产物	iron-sulfur assembly protein IscA-like 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT2G16710` (AT2G16710) Iron-sulfur cluster biosynthesis family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816172] identity=82.6; qcov=0.943; evalue=5.83e-71; confidence=high
Rice	`Os01g0105800` (OsISC9) - identity=82.9; qcov=0.91; evalue=1.11e-68; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding); GO:0097428 (GO:0097428)
KEGG	-
Pfam	PF01521 (Fe-S_biosyn)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019451

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057803986.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803986.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803986.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057803986.1`
5	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.20000	`XP_057803986.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30255799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C43
`Chr1:30256493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C19,C86
`Chr1:30256507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:30256586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803986.1

122 aa

122

Fe-S_biosyn

PF01521 Fe-S_biosyn 6-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803986.1`	Pfam	`PF01521`	Fe-S_biosyn	Domain	6	105	3.7e-18	66.4	Iron-sulphur cluster biosynthesis

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948003.1
ACCAAAAGCCCATTGGGCTTTAAATCGTGTAAATAATCAGCCCAATTTCACAGCCCAAATATATCCATATTTTCACAAACGGTGGCATTTGACCACAACTCGCCGGAGAGATTTCATCGGAGTTCGCTATGCGGAAGCAAGTGCTGTCGTTGACGGAGGCCGCCGCCACTAGAGTGCGCTATCTCTTAGACCAGCGCCACCGCTCTTTCCTCAAGCTCGGCGTCAAGGCTCGCGGCTGCAACGGCCTATCCTACACCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019451
ATGCGGAAGCAAGTGCTGTCGTTGACGGAGGCCGCCGCCACTAGAGTGCGCTATCTCTTAGACCAGCGCCACCGCTCTTTCCTCAAGCTCGGCGTCAAGGCTCGCGGCTGCAACGGCCTATCCTACACCCTCAATTATGCCGATGAGAAAGGAAAGTTTGATGAGTTGGTTGAGGACAAAGGGGTGAAGATCTTAATCGATCCCAAAGCTCTCATGCATGTAATAGGAACCAAGATGGATTTTGTTGATGACAAACTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803986.1
MRKQVLSLTEAAATRVRYLLDQRHRSFLKLGVKARGCNGLSYTLNYADEKGKFDELVEDKGVKILIDPKALMHVIGTKMDFVDDKLRSEFVFINPNSAGQCGCGESFMTISSSEAAAKRSGT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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