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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001424`

染色体: Chr04 坐标: 23185042-23187037 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001424`
名称	SmilChr04G001424
描述	copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	23185042 - 23187037 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019461`
GeneID	`131019461`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019461`
原始查询	`LOC131019461`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic-like
产物	copper-transporting ATPase PAA1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G33520` (PAA1) P-type ATP-ase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829490] identity=79.8; qcov=0.705; evalue=3.85e-37; confidence=medium
Rice	`Os08g0486100` - identity=74.4; qcov=0.732; evalue=1.06e-40; confidence=medium
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0016020 (membrane); GO:0043682 (P-type divalent copper transporter activity); GO:0055070 (copper ion homeostasis)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019461

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057803996.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057803996.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057803996.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057803996.1`
5	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057803996.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:23185351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,D2
`Chr4:23185437`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B8
`Chr4:23185437`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B8
`Chr4:23185474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,C10,C79,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948013.1
TTTTTTTTTTTTTAATAACAAGAAAATTTATTTTTACACATGTAGCTGTCAGTTATGGGCCCCATAGCATGTATAATCCAAAAATGCTTTACTTTCTATCTTCTGCAAAGACTTCTATGACATGTGAGAGCAAGATATTCTGGGCCTATGTACATATATCTGGACTTGGGATTGGTGATTTACGTCTTTTAAATGAGGACAACAAGTTCACATGCTATCAGTTAAGTTACCAAGTCGTGAACCCCAAATTAAAAAGCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019461
ATGCAGTTGCTTGATGCACTGGAGCTAAGTAGACTTACCATGAAGACTGTGAAGCAAAATCTTTGGTGGGCCTTCGCATACAACATTGTAGGAATCCCCGTAGCAGCTGGAACGTTGTTGCCTGTGACTGGAACCATGCTATCACCTTCAATTGCTGGTGCACTTATGGGGTTGAGTTCCATTGGTGTGATGTCGAACTCATTACTTCTCAGATTGAGGTTTAAATCGATAGAGAGAGATATACACAAAACATCTATGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803996.1
MQLLDALELSRLTMKTVKQNLWWAFAYNIVGIPVAAGTLLPVTGTMLSPSIAGALMGLSSIGVMSNSLLLRLRFKSIERDIHKTSMHVKAPSNAENTGNKNARLQPQYPAAR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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