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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001447`

染色体: Chr04 坐标: 23775113-23780217 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001447`
名称	SmilChr04G001447
描述	uncharacterized SmilChr04G001447
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	23775113 - 23780217 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019482`
GeneID	`131019482`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019482`
原始查询	`LOC131019482`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0485700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0485700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G22310` (MBD8) methyl-CPG-binding domain 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838838] identity=38.5; qcov=0.251; evalue=1e-27; confidence=weak
Rice	`Os08g0485700` - identity=27.6; qcov=0.63; evalue=2.25e-36; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01429 (MBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019482

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804009.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804009.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804009.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804009.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804009.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:23775208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A18,A21,A23,A24,A4,B101,B114,B128,B135,B26,B3,B51,B69,B9,C2,C30,C32,C40,C54,C68,C74,C9,D4,D6,D8,D9
`Chr4:23775238`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	83	A1,A14,A18,A2,A3,B1,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B111,B117,B118,B121,B123,B126,B133,B134,B136,B137,B138,B139,B15,B17,B18,B26,B27,B29,B3,B34,B35,B36,B38,B39,B40,B41,B5,B51,B52,B57,B6,B64,B69,B7,B70,B8,B86,B91,B93,B94,C1,C11,C12,C13,C14,C17,C21,C24,C33,C41,C42,C45,C47,C49,C51,C56,C6,C65,C67,C69,C70,C71,C77,C82,C83,D1,D2,D7
`Chr4:23775262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B59,B89,C26,C37
`Chr4:23775348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:23775501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C10
`Chr4:23775566`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B50,C10
`Chr4:23775566`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B50,C10
`Chr4:23775573`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B50,C10
`Chr4:23775573`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B50,C10
`Chr4:23775686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr4:23775692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr4:23775793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B25,B41,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804012.1

713 aa

356

713

MBD

PF01429 MBD 249-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804012.1`	Pfam	`PF01429`	MBD	Domain	249	333	0.00013	22.2	Methyl-CpG binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948028.1
GAGCGTAATTACCAATATGGATTATGAATTTCCGTGATACTCGTAGTTACAAAATCTATGTAATAACGAAATCGAAATACCCTTCTTATCCTCACCAACCTGTAACGCTGCCACCTCCACTCTACCGGTCATCACCCGCCACTCGGCCACTCCGTTTCACACAATTTCACCTCCACTTCGTGCACGCCGAATGTAAAATGGCGAGCGTCGACGCCGTCAATCCTCCGCCTCCTCTCGGGGGAATTAGGGTGGAAGACTTG...

XM_057948027.1
TGATACTCGTAGTTACAAAATCTATGTAATAACGAAATCGAAATACCCTTCTTATCCTCACCAACCTGTAACGCTGCCACCTCCACTCTACCGGTCATCACCCGCCACTCGGCCACTCCGTTTCACACAATTTCACCTCCACTTCGTGCACGCCGAATGTAAAATGGCGAGCGTCGACGCCGTCAATCCTCCGCCTCCTCTCGGGGGAATTAGGGTGGAAGACTTGACTCGTATCGACATCAACCTGCTGTCGCAGTCAG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131019482
ATGAATTTCCGTGATACTCGTAGTTACAAAATCTATGTAATAACGAAATCGAAATACCCTTCTTATCCTCACCAACCTGTAACGCTGCCACCTCCACTCTACCGGTCATCACCCGCCACTCGGCCACTCCGTTTCACACAATTTCACCTCCACTTCGTGCACGCCGAATGTAAAATGGCGAGCGTCGACGCCGTCAATCCTCCGCCTCCTCTCGGGGGAATTAGGGTGGAAGACTTGACTCGTATCGACATCAACCTGCT...

LOC131019482
ATGGCGAGCGTCGACGCCGTCAATCCTCCGCCTCCTCTCGGGGGAATTAGGGTGGAAGACTTGACTCGTATCGACATCAACCTGCTGTCGCAGTCAGAATTGCAAGCCCTCTCTCTATGCTCCGTCTCCGCTCGCCGGAGCGACGACGTCGTGTCTCCGCAGCTAGACCGAACTGTGTTCAACGAGTCCGCCGGCAGCCGCCGCCAGACCTACTCCCGCCTCCACCACCGCTCCCATTCGCGGCTCCCTCGCCTCCACCC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057804009.1
MASVDAVNPPPPLGGIRVEDLTRIDINLLSQSELQALSLCSVSARRSDDVVSPQLDRTVFNESAGSRRQTYSRLHHRSHSRLPRLHPSLKPHSYPQSSSDPVSHSIVHFLKHFLNGNHNPPPPPPPPAPAAPDSPKSPAAAEVGFLGLQENVKFKRKRGRRGRNLSKPPMLLENGVGIELQRVNGRGEMVDFAELENKGDELYGEELKRRTAGLETEEAVLGVLRDLEGQWCSRRKKRKYVDAGTFGDVLPVGWKLLLGL...

XP_057804010.1
MASVDAVNPPPPLGGIRVEDLTRIDINLLSQSELQALSLCSVSARRSDDVVSPQLDRTVFNESAGSRRQTYSRLHHRSHSRLPRLHPSLKPHSYPQSSSDPVSHSIVHFLKHFLNGNHNPPPPPPPPAPAAPDSPKSPAAAEVGFLGLQENVKFKRKRGRRGRNLSKPPMLLENGVGIELQRVNGRGEMVDFAELENKGDELYGEELKRRTAGLETEEAVLGVLRDLEGQWCSRRKKRKYVDAGTFGDVLPVGWKLLLGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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