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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001463`

染色体: Chr04 坐标: 24049927-24051291 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001463`
名称	SmilChr04G001463
描述	protein EXORDIUM-like 2
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	24049927 - 24051291 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019494`
GeneID	`131019494`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019494`
原始查询	`LOC131019494`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein EXORDIUM-like 2
产物	protein EXORDIUM-like 2
Arabidopsis	`AT5G64260` (EXL2) EXORDIUM like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836547] identity=60.1; qcov=1.04; evalue=7.03e-135; confidence=high
Rice	`Os02g0757100` (OsPHI-1) - identity=58.8; qcov=0.983; evalue=3.27e-116; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04674 (Phi_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019494

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057804019.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804019.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804019.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804019.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804019.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:24050204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:24050262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C56
`Chr4:24050504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:24050532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr4:24050533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr4:24050540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,C27,C55
`Chr4:24050583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:24050617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B124,B79
`Chr4:24050638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,C87
`Chr4:24050660`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	91	A1,A10,A13,A18,A2,A23,A25,A3,A4,A7,A9,B10,B100,B101,B103,B105,B11,B110,B118,B121,B123,B125,B127,B128,B131,B133,B136,B138,B14,B140,B16,B17,B19,B2,B21,B22,B25,B26,B37,B38,B42,B43,B47,B48,B49,B5,B50,B56,B58,B6,B60,B65,B78,B8,B83,B84,B87,B88,B93,B94,B95,B99,C10,C11,C13,C14,C19,C20,C30,C43,C46,C47,C52,C53,C55,C58,C63,C65,C67,C71,C72,C73,C79,C80,C83,C87,C9,D10,D11,D7,D8
`Chr4:24050665`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	98	A1,A10,A13,A18,A2,A23,A25,A3,A4,A7,A9,B10,B100,B101,B103,B105,B11,B110,B118,B121,B123,B125,B127,B128,B131,B133,B136,B138,B14,B140,B16,B17,B19,B2,B21,B22,B25,B26,B37,B38,B42,B43,B44,B47,B48,B49,B5,B50,B56,B58,B6,B60,B65,B78,B8,B83,B84,B87,B88,B93,B94,B95,B99,C10,C11,C13,C14,C19,C20,C30,C36,C43,C46,C47,C48,C5,C52,C53,C55,C58,C62,C63,C65,C66,C67,C71,C72,C73,C79,C80,C83,C87,C9,D10,D11,D6,D7,D8
`Chr4:24050694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B14,B65,C33,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804019.1

296 aa

148

296

Phi_1

PF04674 Phi_1 30-295 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804019.1`	Pfam	`PF04674`	Phi_1	Family	30	295	1.4e-120	402.5	Phosphate-induced protein 1 conserved region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948036.1
ATGGGTCCAATTGAATCAGCTTCAGGTCAGGCGCAAACCCATACACAAACACGGACGTCAACATCACCTGCAACGCGACGATCCATGTCATCAAAGAAAACATGCCAGCCTGGCATTATATTCTCTCACCCAATAATTTTACTCCACGTGTCCAAGCGATGTTGACAATCCCCTCCACCATATAAATAGCAGCTGCATATCTTCTCCTTTCCTGAAAACGTAAAAACCATGGCAGCAAATGACTACTTTGCTCCTCTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019494
ATGGCAGCAAATGACTACTTTGCTCCTCTCTTCCTCATCTTCATCTCCTCTTCCATGGCCGCCCTTGTGCAGCAGCAGCCTCTGCTACTCAAGTACCACGACGGCGCCCTCCTCAAGGGCACCGTCACCGTCAATTTGATCTGGTACGGCACCTTCACCCCCACGCAACGCTCCATAATCATCGACTTCCTCGAATCCTTAAATTCTACACAAACCCCCATCCCCTCCGTCGCGTCGTGGTGGAGTACAACGGAGAAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804019.1
MAANDYFAPLFLIFISSSMAALVQQQPLLLKYHDGALLKGTVTVNLIWYGTFTPTQRSIIIDFLESLNSTQTPIPSVASWWSTTEKYNSGQAASTAVVATRQFLDEDYSLGKSLKSSQIKYLAAKGGHANAAINVVLTAKDVAVDGFCMNRCGGHGASRGPARFAYAWVGDAESQCPGYCAWPFHRPVYGPQAAPLVAPNGDVGADGMVVSLAAALAGAVTNPFGEGYFQGEAAAPLEAVTACAGVFGSGAYPGYAGSVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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