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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001499`

染色体: Chr04 坐标: 24579096-24580811 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001499`
名称	SmilChr04G001499
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 15-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	24579096 - 24580811 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019525`
GeneID	`131019525`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019525`
原始查询	`LOC131019525`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 15-like
产物	AT-hook motif nuclear-localized protein 15-like
Arabidopsis	`AT4G14465` (AHL20) AT-hook motif nuclear-localized protein 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827093] identity=52.6; qcov=1.05; evalue=2.58e-68; confidence=high
Rice	`Os02g0448000` - identity=70.2; qcov=0.572; evalue=5.72e-63; confidence=medium
GO	GO:0003680 (minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF03479 (PCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019525

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804054.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804054.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804054.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804054.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804054.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:24579508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C13
`Chr4:24579762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B102,B111,B86,C47
`Chr4:24579821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr4:24579996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B57,B88,C27,C55
`Chr4:24580040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:24580179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804054.1

276 aa

138

276

PCC

PF03479 PCC 96-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804054.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	96	213	4.5e-30	104.9	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948071.1
GAGAGAATGGGGAGCGCAGGGTCAGCAGCCCAAGATGATAAGCTGATGGTGGTCTGACCGACCCTTTATGCTTTGAAAGGGCTAGCATCGGTTGCCAAATACCTCTCTCTCTCTCTGCGACACCTACCCTCTTCTCGCACTTACTTTTTAACTACTTCCTGCCAAATATCATTCATCCTCTCTCCCAATTCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAACCCTAGTTACCCCCGTTCACACTGACTCACTCTCTTTATAACTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019525
ATGGCCAACAGGTGGTGGGCGGGGAATGTGGCGATGAATCCGATGTCATCATCAGCGGCGCCGCCGTCGCTCCACCTGAGAAACTCAGTCGAGGATCACGATGCGTTGAATAACGCGTCGAATAGCAGCGGGAGCAACCCTAACGACGACGGCGAGGAGGGGCAGAACCCCGCCGGCGACATCGAGATCTCGGAGCCGTCGTCGGCCTCCGGGGGCCGGCGCCCCCGGGGCCGCCCCCCTGGGTCGAAGAACAAGCCCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804054.1
MANRWWAGNVAMNPMSSSAAPPSLHLRNSVEDHDALNNASNSSGSNPNDDGEEGQNPAGDIEISEPSSASGGRRPRGRPPGSKNKPRAPIVITKESANALRSHVLEIASGSDVLESIATFAHRRHFGVSVLSGSGVVTNVTLRQPDAPGGVLNLSGRFEILSLSGAFLPSPSPPGSTGLTVYLAGSRGQVVGGPVVGALLASGPVMVIAATFTNATYERLPLEDDGAAGEGMQPQPADQPPPSSAAMYNNVASNLLPNGQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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