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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001638`

染色体: Chr01 坐标: 30417376-30420460 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001638`
名称	SmilChr01G001638
描述	copper transport protein ATX1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30417376 - 30420460 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019533`
GeneID	`131019533`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019533`
原始查询	`LOC131019533`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	copper transport protein ATX1-like
产物	copper transport protein ATX1-like
Arabidopsis	`AT1G66240` (ATX1) homolog of anti-oxidant 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842940] identity=74.2; qcov=0.695; evalue=4.55e-34; confidence=medium
Rice	`Os08g0205400` (OsATX1) - identity=70.4; qcov=0.747; evalue=3.82e-33; confidence=medium
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00403 (HMA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019533

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804077.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804077.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057804077.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057804077.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804077.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30420029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B53
`Chr1:30420178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr1:30420212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr1:30420216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804077.1

105 aa

105

HMA

PF00403 HMA 8-62 aa

XP_057804084.1

95 aa

HMA

PF00403 HMA 1-52 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804077.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	8	62	9.1e-17	61.9	Heavy-metal-associated domain
`XP_057804084.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	1	52	3.5e-15	56.8	Heavy-metal-associated domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948101.1
AATACGAACCCTAAAGAATAGAATGTAGTATTATTAGGTCCACTATCATCGGAAAAATATGCCTTCCTTCTACGATATGCCAAGATTTTTGGTCACCAATTCACAAATTTTCCATTTTCAACAACTTTAGACTGTTGAGCTGAAGGTTGGCATGTCATGCCAAGGCTGCGTGGGAGCTGTTAAGAGGGTTCTCGGAAAATTGGATGGCGTTGAGTCGTACGACATTGATCTCGAGCAGCAGAAAGTGACCGTGAAAGGTA...

XM_057948094.1
TGTCTTCATATTGTATACGCAATCTTATTGTAGTGCTTGTGTTGTGTTTAAACATAATATTTGGGCGCTTTAAGATATATTTACAAAATGAATAATTTTTTTAATATCGCGGAAACTTGCCGTGATTGATGCGCATCGATCTTTTACGATAACATAATTTTGGGGCGCTTTAAAATATATATACTTAAAATATTTTTTTTTTGAATATCGTGGAAACATGCAGTGTTTAATTATACGTATTGATCTTTTATGATAACATA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019533
ATGTCGCAAACTGTTGAGCTGAAGGTTGGCATGTCATGCCAAGGCTGCGTGGGAGCTGTTAAGAGGGTTCTCGGAAAATTGGATGGCGTTGAGTCGTACGACATTGATCTCGAGCAGCAGAAAGTGACCGTGAAAGGTAATGTCCAGCCGGATGTAGTTCTCCAGACTGTTTCAAAGACTGGGAAGGCAACCGCCTTCTGGGAAGCTCCACCACCTGCGGCCCCAGCAGCCGAGGCATCAGCAGCCACGGCGCCAGCTCC...

LOC131019533
ATGTCATGCCAAGGCTGCGTGGGAGCTGTTAAGAGGGTTCTCGGAAAATTGGATGGCGTTGAGTCGTACGACATTGATCTCGAGCAGCAGAAAGTGACCGTGAAAGGTAATGTCCAGCCGGATGTAGTTCTCCAGACTGTTTCAAAGACTGGGAAGGCAACCGCCTTCTGGGAAGCTCCACCACCTGCGGCCCCAGCAGCCGAGGCATCAGCAGCCACGGCGCCAGCTCCAGAGGCACCAGCAGCCGAGCCAGAAATAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804077.1
MSQTVELKVGMSCQGCVGAVKRVLGKLDGVESYDIDLEQQKVTVKGNVQPDVVLQTVSKTGKATAFWEAPPPAAPAAEASAATAPAPEAPAAEPEIKPSETVAAA

XP_057804084.1
MSCQGCVGAVKRVLGKLDGVESYDIDLEQQKVTVKGNVQPDVVLQTVSKTGKATAFWEAPPPAAPAAEASAATAPAPEAPAAEPEIKPSETVAAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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