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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001665`

染色体: Chr04 坐标: 27613201-27617329 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001665`
名称	SmilChr04G001665
描述	DNA-binding protein RHL1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	27613201 - 27617329 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019560`
GeneID	`131019560`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019560`
原始查询	`LOC131019560`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-binding protein RHL1
产物	DNA-binding protein RHL1
Arabidopsis	`AT1G48380` (RHL1) root hair initiation protein root hairless 1 (RHL1) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841258] identity=54.1; qcov=0.834; evalue=1.34e-84; confidence=high
Rice	`Os07g0172200` (P0496D04.23-1) - identity=48.4; qcov=0.855; evalue=3.79e-64; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0042023 (DNA endoreduplication)
KEGG	-
Pfam	PF30943 (RHL1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019560

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804120.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057804120.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057804120.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.80000	`XP_057804120.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804120.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:27616035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:27616055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B50,C7,C76,D1
`Chr4:27616354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr4:27616949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr4:27617022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:27617121`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C44
`Chr4:27617121`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804120.1

290 aa

145

290

RHL1

PF30943 RHL1 66-170 aa

XP_057804121.1

290 aa

145

290

RHL1

PF30943 RHL1 66-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804120.1`	Pfam	`PF30943`	RHL1	Domain	66	170	2.1e-55	186.1	DNA-binding protein RHL1 domain
`XP_057804121.1`	Pfam	`PF30943`	RHL1	Domain	66	170	2.1e-55	186.1	DNA-binding protein RHL1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948137.1
TGCCAAAACAGTTTGCATATAGTATTTCATAAGCTATGGTGAGTAAAATGAAATACGAAATTTAATGAATCACATTACCCGCCTTCCCACAACCGACAACTGAGCTGCTCTGCTCAAGCACGGAAAATGGTTCGAGGAGGCAAGAAAGATGTCACCGCCGCCGACCCGGAGGCGGGAGAGAGGTCACGGCTGAAGAAATTGGCCTTCTCCCGAAACATTCTGTCGCAGGCTGCCGTGAAGGTGGCCACTTCAGATGCTCT...

XM_057948138.1
TGCCAAAACAGTTTGCATATAGTATTTCATAAGCTATGGTGAGTAAAATGAAATACGAAATTTAATGAATCACATTACCCGCCTTCCCACAACCGACAACTGAGCTGCTCTGCTCAAGCACGGAAAATGGTTCGAGGAGGCAAGAAAGATGTCACCGCCGCCGACCCGGAGGCGGGAGAGAGGTCACGGCTGAAGAAATTGGCCTTCTCCCGAAACATTCTGTCGCAGGCTGCCGTGAAGGTGGCCACTTCAGATGCTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019560
ATGGTTCGAGGAGGCAAGAAAGATGTCACCGCCGCCGACCCGGAGGCGGGAGAGAGGTCACGGCTGAAGAAATTGGCCTTCTCCCGAAACATTCTGTCGCAGGCTGCCGTGAAGGTGGCCACTTCAGATGCTCTCGGCCCGTCAAAAACGGTGATCAAGCACCACGGCAGGGATATTTTGAGGAAGTCACAGCGGAAGAACAAATACCTCTTCTCCTTCCCGGGCCTTCTCGGCCCCATTTCTGGTGGAAAAATCGGGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804120.1
MVRGGKKDVTAADPEAGERSRLKKLAFSRNILSQAAVKVATSDALGPSKTVIKHHGRDILRKSQRKNKYLFSFPGLLGPISGGKIGELKDLGTKNPILYLDFPQGQMKLFGTIVYPKNRYLTLQFSKSGKNVTCDDYFENMVVFSDAWWIGTKKENPEELQLEFPKELNKENHAEVDFKGGVGVTSDCKQSSGKPAMKSLERESEKVYLEDELTDGPNDYKELDEMTPTRHSATTAGKMFRFAESSGDDFIENGDETPEE...

XP_057804121.1
MVRGGKKDVTAADPEAGERSRLKKLAFSRNILSQAAVKVATSDALGPSKTVIKHHGRDILRKSQRKNKYLFSFPGLLGPISGGKIGELKDLGTKNPILYLDFPQGQMKLFGTIVYPKNRYLTLQFSKSGKNVTCDDYFENMVVFSDAWWIGTKKENPEELQLEFPKELNKENHAEVDFKGGVGVTSDCKQSSGKPAMKSLERESEKVYLEDELTDGPNDYKELDEMTPTRHSATTAGKMFRFAESSGDDFIENGDETPEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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