当前解析结果
SmilChr04G001664| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001664 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001664 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001664 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 27600546 - 27601251 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131019568 |
|---|---|
| GeneID | 131019568 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019568 |
| 原始查询 | LOC131019568 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019568 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057804129.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057804129.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057804129.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057804129.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057804129.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:27600620 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,A19 |
Chr4:27600639 |
TTA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 12 | A8,B113,B2,B20,B4,B49,B79,B89,C60,C76,C8,D8 |
Chr4:27600650 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B19,B70,B82 |
Chr4:27600672 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B103,B64,C14,C81,D8 |
Chr4:27600702 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A19,C15 |
Chr4:27600740 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B22 |
Chr4:27600747 |
AC |
* |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr4:27600762 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | D10 |
Chr4:27600762 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:27600777 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B54,B84 |
Chr4:27600793 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B52,C39,C50,C75 |
Chr4:27600913 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B34,B50,C7,C76,D1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。