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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001733`

染色体: Chr04 坐标: 28563241-28566927 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001733`
名称	SmilChr04G001733
描述	uncharacterized SmilChr04G001733
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28563241 - 28566927 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019614`
GeneID	`131019614`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019614`
原始查询	`LOC131019614`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0379800; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0379800; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G17450` (AT3G17450) hAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821009] identity=39.9; qcov=0.986; evalue=6.08e-64; confidence=medium
Rice	`Os01g0379800` - identity=39; qcov=0.983; evalue=2.31e-65; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019614

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057804187.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057804187.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057804187.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804187.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804187.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28564633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B88
`Chr4:28564633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr4:28564658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr4:28564672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:28564678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr4:28564682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr4:28564716`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C50
`Chr4:28564716`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C50
`Chr4:28564719`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C50
`Chr4:28564719`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C50
`Chr4:28564724`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	53	A10,A19,A25,A3,A9,B101,B117,B118,B122,B132,B135,B140,B17,B21,B22,B25,B35,B42,B44,B57,B60,B65,B67,B71,B75,B76,B78,B80,B81,B85,B93,B95,B98,B99,C13,C17,C19,C30,C32,C39,C44,C45,C48,C49,C5,C53,C67,C7,C72,C73,C75,C79,C84
`Chr4:28564761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A21,A22,A5,B20,B3,B34,B40,B86,B96,B97,C14,C28,C50,C54,C83,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804187.1

287 aa

144

287

DUF659

PF04937 DUF659 53-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804187.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	53	203	1.3e-56	191.1	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948204.1
ATAAATCAAATTAATCACAAATTATTATTTTTATCATGATCAATATCAATGTTGTGAAAATCGAATGAGGCGGCCGCCTTGAGGCGCGCCTCAAGGCGAGGCGGTGATAAACCCGCACCGCACATACGCCTTTATGCATATTTTACAAATTAGCGCCTTAGTGCAATTGAGGCGCCGCCTCAAGGAATCAAATTATGAATGCGGCGGTAATAAATAAGTCAACTTTTAACCTATCACAGCCGCAATTATTGACCTCTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019614
ATGTCTCTCCATGTCAAAGAAGCAAGAAATCACGTGGCAATGGATATTGGACGATTTTTCTTTGAAAATGGGATTTCGTTCAATTGTATCGAGTCTCTATCATTTGTCAGCATGTGTAGGTCCATCGGATTGTATGGAAAAGGTTTGAAGGTTTCTTCTAAACATAAGTTGAGTACGTGGATTTTGAAGGAAGAAGTCAAGACAACGGACGTGATTGTTGATGATATCAAAAGATCTTGGATACAAACAGGTGTATCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804187.1
MSLHVKEARNHVAMDIGRFFFENGISFNCIESLSFVSMCRSIGLYGKGLKVSSKHKLSTWILKEEVKTTDVIVDDIKRSWIQTGVSILSDGWKDMRGRSLINFLVNNPHSTVFLRSIDASDAVKDANLLFQLLDGIVEEIGEELVVQVVTDNASNYKAAGKLLMEKRKSLYWTPCVAHCIDLMFEKLGELPQHKNALMKARKVSNFIYNHGLVLAMMRKHTDRELIRPATTRFATTFLALESMMELRQPLQAMFTSADWE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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