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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001754`

染色体: Chr04 坐标: 28860724-28864600 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001754`
名称	SmilChr04G001754
描述	probable galactinol--sucrose galactosyltransferase 2
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28860724 - 28864600 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019628`
GeneID	`131019628`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019628`
原始查询	`LOC131019628`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable galactinol--sucrose galactosyltransferase 2
产物	probable galactinol--sucrose galactosyltransferase 2
Arabidopsis	`AT3G57520` (SIP2) seed imbibition 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824919] identity=52; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0481100` - identity=59.7; qcov=0.956; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05691 (Raffinose_syn)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019628

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804202.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804202.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804202.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804202.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804202.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28861031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C82
`Chr4:28861076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:28861152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:28861180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C23,C82
`Chr4:28861188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:28861429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B13
`Chr4:28861577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C9
`Chr4:28861637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr4:28861638`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B105,C9
`Chr4:28861638`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B105,C9
`Chr4:28861643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75
`Chr4:28861659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C26,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804202.1

742 aa

371

742

Raffinose_syn

PF05691 Raffinose_syn 9-728 aa

XP_057804203.1

742 aa

371

742

Raffinose_syn

PF05691 Raffinose_syn 9-728 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804202.1`	Pfam	`PF05691`	Raffinose_syn	Family	9	728	1.6e-268	893.3	Raffinose synthase or seed imbibition protein Sip1
`XP_057804203.1`	Pfam	`PF05691`	Raffinose_syn	Family	9	728	1.6e-268	893.3	Raffinose synthase or seed imbibition protein Sip1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948220.1
TTCCCAACTACCGATTTTCCAAATCATCTCAATCTTTAGCTGCTTCCCTTTTGTTCCCTTGATCCCATTGGCCCATTCCACCTATTTAAAGCCAAATTTTGAATCATAGCTCCTCACCTCTGATCTCATTCTTCTTCTCTTCTACTCTTGTTTCTCATTTCATTAAGGCAGTTGAGACATTTTAGATTGTTGAAACCCGAAAAACGCCTTGGTAAACTGTAGCAAAACAAAAGGAAAAATGACTATCACAGCTGTGCCAG...

XM_057948219.1
TCCCAACTACCGATTTTCCAAATCATCTCAATCTTTAGCTGCTTCCCTTTTGTTCCCTTGATCCCATTGGCCCATTCCACCTATTTAAAGCCAAATTTTGAATCATAGCTCCTCACCTCTGATCTCATTCTTCTTCTCTTCTACTCTTGTTTCTCATTTCATTAAGGCAGTTGAGACATTTTAGATTGTTCTTGCAGTTGAAACCCGAAAAACGCCTTGGTAAACTGTAGCAAAACAAAAGGAAAAATGACTATCACAGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019628
ATGACTATCACAGCTGTGCCAGTGATCAAGAATGGGTGCCTCATGGTTCGGGGCAAGGTTGTCTTAACCGGAGTTCCAAACAACGTTGTCATCACCCCAGCAAGCTCGGGATCAGCCTTCATTGGAGCCACTTCGACTAGCTCGAGCTCACACCATGTCTTCAATCTTGGGACTCTCGAAAACTACAGATTCATGTGCCTCTTCATCGCGAAGATCTGGTGGATGATACCGCGTGTTGGGAGATCAGCTAGTGAGATTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804202.1
MTITAVPVIKNGCLMVRGKVVLTGVPNNVVITPASSGSAFIGATSTSSSSHHVFNLGTLENYRFMCLFIAKIWWMIPRVGRSASEIPMETQMLLLEAEEESVLELLDEESTTSGNKTYVLVLPVLDGAFRTTLQGTKSNELHFCYESGDPDIQTSQALEGVFVSSGDNPFELLKDSIKILAKHKGTFSHLENKKAPAHVDWFGWCTWDAFYTDVTPHGIKEGLQSFKEGGISPKYLIIDDGWQETENEFKKEGEPVIEGT...

XP_057804203.1
MTITAVPVIKNGCLMVRGKVVLTGVPNNVVITPASSGSAFIGATSTSSSSHHVFNLGTLENYRFMCLFIAKIWWMIPRVGRSASEIPMETQMLLLEAEEESVLELLDEESTTSGNKTYVLVLPVLDGAFRTTLQGTKSNELHFCYESGDPDIQTSQALEGVFVSSGDNPFELLKDSIKILAKHKGTFSHLENKKAPAHVDWFGWCTWDAFYTDVTPHGIKEGLQSFKEGGISPKYLIIDDGWQETENEFKKEGEPVIEGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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