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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001771`

染色体: Chr04 坐标: 29101225-29104450 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001771`
名称	SmilChr04G001771
描述	ammonium transporter 2 member 3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29101225 - 29104450 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019647`
GeneID	`131019647`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019647`
原始查询	`LOC131019647`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ammonium transporter 2 member 3-like
产物	ammonium transporter 2 member 3-like
Arabidopsis	`AT2G38290` (AMT2) ammonium transporter 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818409] identity=61.1; qcov=0.941; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0870300` (OsAMT3) - identity=62.5; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0008519 (ammonium channel activity); GO:0072488 (ammonium transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00909 (Ammonium_transp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019647

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804217.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057804217.1`
3	Endosome	内体	0.20000	`XP_057804217.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.20000	`XP_057804217.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804217.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29101758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B80
`Chr4:29101795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B131
`Chr4:29102951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B73,C81
`Chr4:29102993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,A5,B29,B69,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804217.1

475 aa

238

475

Ammonium_transp

PF00909 Ammonium_transp 30-443 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804217.1`	Pfam	`PF00909`	Ammonium_transp	Family	30	443	3.5e-78	263.8	Ammonium Transporter Family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948234.1
GGGGTCGAATTTTACGAGAATCTAGCCTGCAAATAAAATTATTACAAATATTGCTATTGCCAGCATCGGCGATTCCCGGTTGGAATCTGCCTGTCATTCGCCCAAGACAAAAAGAAGAATGTTAGAGTATCATTTTGTCCAAACAAGAGACATAGATATTACCAATGCGCATCGCCTATTTATCTGACGTCCCGCTTTGGATGTGAAAAAACTTGCCCGCTTAAAACAATTTGGTTTGTGAATGGGTATGGCTAATTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019647
ATGGGTATGGCTAATTACACAGTATTACCATATGGGCTAATTCCCGACGATGCATCACCCGAGTGGCTAAACAAAGGCGACAACGGGTGGCAGATGACGTCGGCCGCCATGGTGGGCCTCCAGAGCGTGCCGGGGCTCGTGATACTGTACGGGAGCATGGTGAAGAAAAAGTGGGCCGTGAACTCGGCGTTCATGGCCCTCTACGCCTTCGCGGCCGTGCTCCTCTGTTGGGTGCTTTGGGCCTACGAGATGTCGTTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804217.1
MGMANYTVLPYGLIPDDASPEWLNKGDNGWQMTSAAMVGLQSVPGLVILYGSMVKKKWAVNSAFMALYAFAAVLLCWVLWAYEMSFGSSMIPVLGKPDARGAAEKYLLSQNRLGGYIPIADYVFYQFAFAAITVILLGGSLLGRMNFYAWMLFVPLWTTLSYTVGAHTIWGRGFLTDQIIDYAGGYVIHLSSGVAGLTAAYWVGPRHSDDRQHFPPNNIINMLGGAGFLWMGWTGFNGGAPMAASEITSLAVLNTHVCTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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