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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001801`

染色体: Chr04 坐标: 29488560-29489636 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001801`
名称	SmilChr04G001801
描述	high-affinity nitrate transporter 3.1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29488560 - 29489636 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019674`
GeneID	`131019674`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019674`
原始查询	`LOC131019674`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	high-affinity nitrate transporter 3.1-like
产物	high-affinity nitrate transporter 3.1-like
Arabidopsis	`AT5G50200` (WR3) nitrate transmembrane transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835085] identity=51.8; qcov=0.985; evalue=3.91e-66; confidence=high
Rice	`Os02g0595900` (NAR2.1) - identity=50; qcov=0.851; evalue=2.75e-59; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0010167 (response to nitrate); GO:0015112 (nitrate transmembrane transporter activity); GO:0015706 (nitrate transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF16974 (NAR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019674

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057804248.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057804248.1`
3	Lysosome	溶酶体	0.40000	`XP_057804248.1`
4	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057804248.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057804248.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29488891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,C30,C49,C82
`Chr4:29488906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:29488947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:29489053`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B136,B46,B55,C23,C24,C58
`Chr4:29489124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr4:29489329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:29489383`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	52	A13,A19,A25,A5,B10,B103,B104,B105,B109,B11,B114,B118,B122,B128,B134,B18,B22,B25,B26,B29,B3,B31,B57,B65,B69,B7,B74,B81,B86,B88,B90,B92,B98,C10,C27,C31,C33,C4,C48,C55,C57,C6,C67,C73,C8,C80,C82,C84,C9,D10,D11,D7
`Chr4:29489385`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	52	A13,A19,A25,A5,B10,B103,B104,B105,B109,B11,B114,B118,B122,B128,B134,B18,B22,B25,B26,B29,B3,B31,B57,B65,B69,B7,B74,B81,B86,B88,B90,B92,B98,C10,C27,C31,C33,C4,C48,C55,C57,C6,C67,C73,C8,C80,C82,C84,C9,D10,D11,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804248.1

202 aa

101

202

NAR2

PF16974 NAR2 26-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804248.1`	Pfam	`PF16974`	NAR2	Domain	26	167	1.5e-62	210.0	High-affinity nitrate transporter accessory, Ig-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948265.1
TTGTAATAAGACAAGTCAACTACAAAATTAATAAATACTGTAATACATACCCCGCCCTCTCAGCACAATTTTGAGCCACTTTTCGTGTTATATAATGATTGCAAGAGTTCAGCCACTTGTTGTGTTTTGATCTTTTTTTTATTACATTTTTCTTCTATATAAGAATAAGAAATCTCAGTTTTAAGGTCATCCGCAACTTCCAGTACTTAACTCAAAGCTTTCTTCAACAGTCTTATCAATGAGGAGCAGCGCAGCTTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019674
ATGAGGAGCAGCGCAGCTTGCCTGGTGGTTTCACTATGGATTTCGTGTTTGCTGGGCTCTACCTACGCCGCCACATTCTCTTCTCTCCACAGAACTCTCATCCTCACCGCTTCACCTAAAGCCGGACAAGTTTTGAAGGCCGGAGAGGACAACATAACCCTAACCTGGTCCCTCAACACCACCTTCGCATCCGGGATCGACTCCACCTACAAAAGCGTGACGGTGAAGCTGTGCTACGCCCCGATCAGCCAGAAGGATCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804248.1
MRSSAACLVVSLWISCLLGSTYAATFSSLHRTLILTASPKAGQVLKAGEDNITLTWSLNTTFASGIDSTYKSVTVKLCYAPISQKDRGWRKTVDELAKDKTCQHKILTKPYTSSNNTFTWSVRRDVPGATYFVRAYALDSAAKEVAFGQTTDSHKTTNLFEVEAVTGRHVSLDIASVCFSAFSIVSLLGFFFMEKRKAKSSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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