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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001821`

染色体: Chr04 坐标: 29726378-29728330 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001821`
名称	SmilChr04G001821
描述	uncharacterized SmilChr04G001821
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29726378 - 29728330 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019691`
GeneID	`131019691`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019691`
原始查询	`LOC131019691`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=24.8; qcov=0.981; evalue=7.74e-19; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=29.7; qcov=0.973; evalue=8.47e-30; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019691

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804266.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057804266.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804266.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804266.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804266.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29726503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr4:29726512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B107
`Chr4:29726512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr4:29726524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B28
`Chr4:29726527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr4:29726547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:29726555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B77
`Chr4:29726567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B28,B40,C16,C61
`Chr4:29726576`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A22,A24,A25,A3,B10,B103,B104,B106,B107,B33,B70,B78,B8,B92,B99,C12,C21,C29,C31,C49,C56,C77,C82
`Chr4:29726589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr4:29726625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	76	A19,A2,A20,A24,A25,A4,A5,A9,B103,B105,B11,B113,B114,B118,B122,B127,B132,B134,B135,B139,B140,B18,B21,B22,B24,B28,B31,B41,B44,B45,B47,B50,B51,B54,B58,B65,B68,B71,B73,B74,B8,B81,B83,B84,B87,B9,B96,B98,C10,C15,C21,C23,C26,C30,C32,C41,C46,C49,C50,C54,C56,C57,C59,C6,C62,C65,C66,C7,C70,C73,C78,C79,C84,D1,D7,D9
`Chr4:29726635`	`CT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B128,B61,C3,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804266.1

263 aa

132

263

SWIM

PF04434 SWIM 118-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804266.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	118	152	7.3e-07	29.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948283.1
GTCCAGAGTTGCTGATTTGGGGAAGAACTCTTTTTACAACAGTAAAGAAGAATTGGTCCTTGCTGTTGGCTTCTGGAATATGAAGCAAGGGGCTGAGGCAAAAGTTGTACGCTTAGATCAGGGACGCCTCTATTACAAGTGCAAGCACTCTGATAAGTGCAAGTTCGATGTGCGTGCATCTTGTCACGGCGGAGGGATGTGGGGAGTGCATAAGTTTAAAGAGCACTCTTGCCAAGGGGAATTGGGCATTTTGAAACGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019691
ATGTCGGCTATGGCTCAATTGAAGCCGGCGGCGTACGGGAAGTTGATGCGCGTAGGCCCTGAGAAGTGGGCACGATCACAAAGTCCGGTGACCCGTTATAGTTTTCTTACAGCTAATGCTGCCGAGGCTTTGAATGCCCGTTTGTTGTGGGCCAGACGCCTTCCTATATGCTCCATGCTGGAGGCAATCAGGATGGTTCTGGAGCAGTGGTTCAATGACAGACTTGCATCTGCGGAAGAGAGCGATGATCTTCTTACTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804266.1
MSAMAQLKPAAYGKLMRVGPEKWARSQSPVTRYSFLTANAAEALNARLLWARRLPICSMLEAIRMVLEQWFNDRLASAEESDDLLTPEATQKISAEISKSRRYTAKRTSERKYRVRAGDRRFMVDLQAKSCECNEFDLDGMPCSHAIAAITEAKEPVEDYVEAYYLRSSLVQTYSGSVNHLPPLEHWEIPFEVATDIVLPNLSRRQAGRPRESRIPSAGERPTQRTTTTDASSSLGKRAPKTCGLCGSPGHTRRACKGTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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