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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001857`

染色体: Chr04 坐标: 30249392-30251543 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001857`
名称	SmilChr04G001857
描述	protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	30249392 - 30251543 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019718`
GeneID	`131019718`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019718`
原始查询	`LOC131019718`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES
产物	protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES
Arabidopsis	`AT5G63090` (LOB) Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836429] identity=59.9; qcov=1.16; evalue=1.5e-70; confidence=high
Rice	`Os01g0169400` (ra2) - identity=84; qcov=0.624; evalue=6.66e-66; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03195 (LOB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019718

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804291.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804291.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804291.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804291.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804291.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:30250788`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A13
`Chr4:30250788`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A13
`Chr4:30250832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C57,C82
`Chr4:30250838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B135,C37
`Chr4:30250850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C30,C49
`Chr4:30250879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr4:30251095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr4:30251104`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C60
`Chr4:30251104`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804291.1

170 aa

170

LOB

PF03195 LOB 10-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804291.1`	Pfam	`PF03195`	LOB	Family	10	107	3e-40	137.5	Lateral organ boundaries (LOB) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948308.1
AAAGGCGAGGAGGAAAATAGAAATATGGCATGTAACAGTAAGGAAAAAAATAGGGATTGCATCCCCTCCACAAGTATGATAAAATTATTAGATGCAGTGTCACAGTCATCTTTTTTCTTTAGTGTACCTCTCATTTATTATCTTTGTCCTTTGCATTCATTCCTTCTTCATCTCACTATATGCTCTTAATTTGCTCCTCTCTCAACCTTGCTTCCCATTATCACATTGAAATTCCCCAAAATATTGATCCAAATTAGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019718
ATGGCTTCATCGAGCTCGTACAACCCGCCGTGCGCCGCGTGCAAGTTCCTGCGGCGGAAGTGCATGCCGGGGTGCATCTTCTCGGCCTACTTCCCGCCGGAGGAGCCGCAGAAGTTCGCCAACGTGCACAAGATCTTCGGGGCCAGCAACGTGGCGAAGCTGCTTAACGAGCTGCTGCCGCACCAGCGCGACGACGCCGTCAACTCCCTCGCCTACGAGGCCGAGGCGCGCGTTCGCGACCCCGTCTACGGCTGCATCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804291.1
MASSSSYNPPCAACKFLRRKCMPGCIFSAYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVAKLLNELLPHQRDDAVNSLAYEAEARVRDPVYGCIGAISFLQRQVDRLQKELDAANADLIRFACTPPPPPPDPNRRIGGYNGGGGGGARFYQTGSLPISYAVPWNDIYNSHGGGMDGNN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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