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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001859`

染色体: Chr04 坐标: 30286934-30290881 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001859`
名称	SmilChr04G001859
描述	carbamoyl-phosphate synthase small chain, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	30286934 - 30290881 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019719`
GeneID	`131019719`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019719`
原始查询	`LOC131019719`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	carbamoyl-phosphate synthase small chain, chloroplastic-like
产物	carbamoyl-phosphate synthase small chain%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G27740` (CARA) carbamoyl phosphate synthetase A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822396] identity=74.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0708100` (GAT1) - identity=76; qcov=0.967; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004088 (carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolyzing) activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005951 (carbamoyl-phosphate synthase complex); GO:0006207 ('de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process); GO:0006526 (L-arginine biosynthetic process); GO:0006541 (L-glutamine metabolic process)
KEGG	smil00220 (Arginine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00250 (Alanine, aspartate and glutamate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00117 (GATase); PF00988 (CPSase_sm_chain); PF07722 (Peptidase_C26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019719

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057804293.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057804293.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057804293.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804293.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804293.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:30287661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr4:30288017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:30288138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr4:30288186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B34,B78,C33,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804293.1

419 aa

210

419

CPSase_sm_chain

GATase

Peptidase_C26

PF00988 CPSase_sm_chain 49-173 aa PF00117 GATase 235-410 aa PF07722 Peptidase_C26 299-359 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804293.1`	Pfam	`PF00988`	CPSase_sm_chain	Domain	49	173	1.7e-49	167.5	Carbamoyl-phosphate synthase small chain, CPSase domain
`XP_057804293.1`	Pfam	`PF00117`	GATase	Domain	235	410	2.1e-56	191.3	Glutamine amidotransferase class-I
`XP_057804293.1`	Pfam	`PF07722`	Peptidase_C26	Domain	299	359	1.2e-05	25.9	Peptidase C26

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948310.1
CACATTTTCTTTTTTAGTTTGAGTGAGACATTTAAACGGTGATAAGTAATAGAAACAGAACACACACACAAGAGACAGAGACACTCAATACGATCCCTAGCCGCCGCCGCCCGCAGCTGCAGCTCCGCCTCTTCTACAGCCATGGCCATGGCGTGCTCTCAGTTCGCCTACTGCTTGACATCAACCCTTCAAAATCCGCGGTTCTTCACCGTCAGCTGCCGCTCCGTTTCCACCGAGAATGGGTTAGGGTTGGCGGAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019719
ATGGCCATGGCGTGCTCTCAGTTCGCCTACTGCTTGACATCAACCCTTCAAAATCCGCGGTTCTTCACCGTCAGCTGCCGCTCCGTTTCCACCGAGAATGGGTTAGGGTTGGCGGAGCGGCCGTGGAAGGTGGCAGACGCCAGGCTGGTGCTGGAGGACGGCTCCGTCTGGAAGGCTAAGTCATTCGGTGCTTCTGGAACTCAAGTTGGCGAAGTCGTTTTCAATACATCCTTGACTGGGTACCAGGAGATCCTTACAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804293.1
MAMACSQFAYCLTSTLQNPRFFTVSCRSVSTENGLGLAERPWKVADARLVLEDGSVWKAKSFGASGTQVGEVVFNTSLTGYQEILTDPSYAGQFVLMTNPHIGNTGVNFDDEESRQCFLAGLVIRSLSISTSNWRCEETLGDYLASRNIMGIYDVDTRAITRRLRQDGSLIGVLSTEESKTDDELLNMSRTWDIVGVDLISGVSCEAPYEWVDKTGSEWEFNSNGRNQETFHVVAYDFGIKSNILRRLASYGCKITVVPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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