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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001659`

染色体: Chr01 坐标: 30673941-30676444 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001659`
名称	SmilChr01G001659
描述	protein IQ-DOMAIN 17-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30673941 - 30676444 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019739`
GeneID	`131019739`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019739`
原始查询	`LOC131019739`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IQ-DOMAIN 17-like
产物	protein IQ-DOMAIN 17-like
Arabidopsis	`AT4G00820` (iqd17) IQ-domain 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828002] identity=33.8; qcov=1.18; evalue=6.13e-50; confidence=low
Rice	`Os08g0115200` - identity=32.8; qcov=1.27; evalue=5.12e-53; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00612 (IQ); PF13178 (DUF4005)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019739

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057804308.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057804308.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057804308.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057804308.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804308.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30674237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:30674328`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B19
`Chr1:30674328`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B19
`Chr1:30674331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr1:30674402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C1
`Chr1:30674455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,C60,D4,D9
`Chr1:30674486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:30674960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C1
`Chr1:30674996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,D5
`Chr1:30675169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,C60,D4,D9
`Chr1:30675179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:30675201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804308.1

394 aa

197

394

DUF4005

PF00612 IQ 129-146 aa PF00612 IQ 151-170 aa PF13178 DUF4005 327-386 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804308.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	129	146	3.1e-08	33.4	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057804308.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	151	170	3.1e-08	33.4	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057804308.1`	Pfam	`PF13178`	DUF4005	Family	327	386	2.5e-15	57.6	Protein of unknown function (DUF4005)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948325.1
GAACTACTTTTTTTGGTTTATTCCATAAAAGGGCAGAATGTCAGCAGCTACTCCATGCCTCTAACTACATAGTGGTTAACTAAAGTACACCACTTTGTTAGATACTGTTTCCCTCAGGACTCCCATTTTCCCAATCCCCCAAAAACTCATCTTCGTTTCATGGGGAAGAAGACTGGGAATTCCTGGCTCAACGCTGTGAAGAAGGCCTTCAGATCTCCCACCAACGATGATGACGACAAGAGGAGCAGCAGAAGACGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019739
ATGGGGAAGAAGACTGGGAATTCCTGGCTCAACGCTGTGAAGAAGGCCTTCAGATCTCCCACCAACGATGATGACGACAAGAGGAGCAGCAGAAGACGACAACATAACGAGCCAGAAGATGAGGAAAAAAAAAGAGGGAAGAAGAGATGGATATTTCGGAGGCATTTAAGTCTGGAGACGACGATCCAGCACAACGTTGTCAAATGCGCGAATTCTATTTGCAGCGGAGAGGAGAATTTGGTGAGGAAGCAGCCCAGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804308.1
MGKKTGNSWLNAVKKAFRSPTNDDDDKRSSRRRQHNEPEDEEKKRGKKRWIFRRHLSLETTIQHNVVKCANSICSGEENLVRKQPRMDTEQKRAFAVAMATTAAAEAAVATAVEIIRLSRPPLLVKQDKAALLIQKIFRGYLARRALMALRGVVKLQALIRGHNVRKRAKMTLQCIQSLVRVQAIVCDQRRRLSCETTATLGSMFRNDSSRVSNSLDVGPTELEEIHALIQKAKECSLEQGKTLAHALSQQIWATEVEDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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