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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000553`

染色体: Chr01 坐标: 11505769-11509674 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000553`
名称	SmilChr01G000553
描述	uncharacterized SmilChr01G000553
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	11505769 - 11509674 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019767`
GeneID	`131019767`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019767`
原始查询	`LOC131019767`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827633]; symbol=AT4G18975; hit=AT4G18975; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827633]; symbol=AT4G18975; hit=AT4G18975; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G18975` (AT4G18975) Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827633] identity=62; qcov=0.485; evalue=3.98e-52; confidence=medium
Rice	`Os07g0545900` - identity=53.2; qcov=0.289; evalue=9.8e-22; confidence=weak
GO	GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF07524 (Bromo_TP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019767

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057804358.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057804358.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804358.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804358.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804358.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:11505862`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A1,A14,A19,A2,A9,B10,B101,B106,B108,B117,B123,B136,B20,B21,B3,B30,B31,B40,B86,C4,C43,C50,C57,C64,C66,C76
`Chr1:11505876`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A21,A4,A9,B106,B111,B117,B123,B127,B131,B136,B21,B22,B3,B33,B4,B40,B51,B56,B7,B85,B86,B91,C23,C50,C66
`Chr1:11505880`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A16,A21,A9,B106,B111,B117,B123,B127,B136,B140,B21,B3,B33,B40,B51,B56,B7,B74,B91,C35,C49,C50,C66,C71
`Chr1:11505905`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	198	A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A21,A22,A23,A3,A4,A5,A6,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B12,B121,B123,B124,B125,B127,B128,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B138,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B33,B34,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B65,B66,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B79,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C21,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C33,C34,C36,C38,C39,C40,C41,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C80,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D6,D7,D8,D9
`Chr1:11505954`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A10,B11,B75,C27,C41,C71
`Chr1:11505961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:11505963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr1:11505983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B53,B63
`Chr1:11506850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B49,B85,C24,C38,C67
`Chr1:11506874`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B3,B49,B85,C24,C38,C63,C67
`Chr1:11506880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:11506956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B68,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804358.1

266 aa

133

266

Bromo_TP

PF07524 Bromo_TP 24-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804358.1`	Pfam	`PF07524`	Bromo_TP	Domain	24	73	1.8e-13	51.0	Bromodomain associated

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948375.1
ATGAGCGATGTTGGTGAAGCTGAAGGCAGGAGAGATGAACAGAATGATTCGAATTTGCGATCTGGTGCTGGATTCAACGAGTCTGCTCTTGATTCGCTTGCTGATATTGCGATTAGGTACATCTGTGAGTTAGGTAAAACCTCCAGATTTTACGCGAATTTAGCTGGTAGGACGGGTTGCAACGTCTTTGATATTGTCCAAGCGTTGGAAGACTTGGGCACGCCACAAGGGTTTACTGGTGCTTCAGAGGTTCACGCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019767
ATGAGCGATGTTGGTGAAGCTGAAGGCAGGAGAGATGAACAGAATGATTCGAATTTGCGATCTGGTGCTGGATTCAACGAGTCTGCTCTTGATTCGCTTGCTGATATTGCGATTAGGTACATCTGTGAGTTAGGTAAAACCTCCAGATTTTACGCGAATTTAGCTGGTAGGACGGGTTGCAACGTCTTTGATATTGTCCAAGCGTTGGAAGACTTGGGCACGCCACAAGGGTTTACTGGTGCTTCAGAGGTTCACGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804358.1
MSDVGEAEGRRDEQNDSNLRSGAGFNESALDSLADIAIRYICELGKTSRFYANLAGRTGCNVFDIVQALEDLGTPQGFTGASEVHADCAVSSGAIREIKVYVEAADEVAKWMLSKGQGATMATYDHLLLAFDMDIRPDEAKMLWNMILHAHDQTISKRLFSRMISLYDRHNMPNNVIEVFADMEELGVKPDEDTVRRIARAFEALGQEDKQKQFLTKYQRNWKYIHFKGGKSSSKNLIPRIIQLDKGWIHGVKLPHVKES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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