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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001062`

染色体: Chr04 坐标: 15210017-15214423 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001062`
名称	SmilChr04G001062
描述	protein PIN-LIKES 6
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	15210017 - 15214423 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019806`
GeneID	`131019806`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019806`
原始查询	`LOC131019806`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PIN-LIKES 6
产物	protein PIN-LIKES 6
Arabidopsis	`AT5G01990` (AT5G01990) Auxin efflux carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830729] identity=71.6; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0818000` (OsPILS6a) - identity=66.9; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0080162 (endoplasmic reticulum to cytosol auxin transport)
KEGG	-
Pfam	PF03547 (Mem_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019806

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057804381.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057804381.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057804381.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804381.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804381.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:15210603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:15210635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr4:15211068`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B14
`Chr4:15211068`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B14
`Chr4:15211069`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B14
`Chr4:15211069`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B14
`Chr4:15211079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:15211097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:15211104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr4:15213856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:15213903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:15214138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804381.1

423 aa

212

423

Mem_trans

PF03547 Mem_trans 29-415 aa

XP_057804382.1

423 aa

212

423

Mem_trans

PF03547 Mem_trans 29-415 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804381.1`	Pfam	`PF03547`	Mem_trans	Family	29	415	6.1e-90	302.0	Membrane transport protein
`XP_057804382.1`	Pfam	`PF03547`	Mem_trans	Family	29	415	6.1e-90	302.0	Membrane transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948399.1
CGAATAGAAGGGAGTTCTTAATTGCGGCAATAGCTTTTCTAATTTGATTCGATTTAACGTAAGATTCGTCAGCAAAATTCTGGAAAAGGGTTTGGGCCCCACTTACCGTCTTCGCGAATAGGAAATTGTGAGAGAGAAGGAGGTGTTTGATGATCAGGAAGAGACCGCGCCAGCGACGCCATCGACTTACAATCACACAACAATTGCTCCTTCTTCCCCGTGAATTCCGAGTTTTTCATTACAAATATCACTCGCAGACT...

XM_057948398.1
AATAGCTTTTCTAATTTGATTCGATTTAACGTAAGATTCGTCAGCAAAATTCTGGAAAAGGGTTTGGGCCCCACTTACCGTCTTCGCGAATAGGAAATTGTGAGAGAGAAGGAGGTGTTTGATGATCAGGAAGAGACCGCGCCAGCGACGCCATCGACTTACAATCACACAACAATTGCTCCTTCTTCCCCGTGAATTCCGAGTTTTTCATTACAAATATCACTCGCAGACTCGCTTACGATTCATTCTTTTTCTTCGAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019806
ATGGAAGGGGTGCAGAGGTTACTGATCGAGGTCCTAACCGAGCCCCAAAAGGGCGGCCAGTCAGTTCTTGGTACAATGAAGGTTGCGGTTCTGCCCATAGCCAAAGTTTTTACCATGTGCTTTCTGGGCCTTCTTATGGCTTCCAAGTATGTTAATATCTTGCCTTCTAATGGCAGAAAGCTCTTAAATGGGCTGGTCTTCTCACTTCTGCTCCCATGTTTGATATTTTCGCAATTGGGACAAGCAATAACTTTTGAGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804381.1
MEGVQRLLIEVLTEPQKGGQSVLGTMKVAVLPIAKVFTMCFLGLLMASKYVNILPSNGRKLLNGLVFSLLLPCLIFSQLGQAITFEKMIEWWFIPVNVVIASITGSIIGFVIASIVRPPYPYFKFTIVQIGIGNIGNVPLVLIAALCRDKSNPFGDTDKCSQDGNAYISFGQWVGAIILYTYVFQMLAPPPGGYDAEDGNLTLKNSARNSPRALASDDSPERLPLLAEEATPVYSSSTKKDKIKDFLKYIYEKLKLKQIV...

XP_057804382.1
MEGVQRLLIEVLTEPQKGGQSVLGTMKVAVLPIAKVFTMCFLGLLMASKYVNILPSNGRKLLNGLVFSLLLPCLIFSQLGQAITFEKMIEWWFIPVNVVIASITGSIIGFVIASIVRPPYPYFKFTIVQIGIGNIGNVPLVLIAALCRDKSNPFGDTDKCSQDGNAYISFGQWVGAIILYTYVFQMLAPPPGGYDAEDGNLTLKNSARNSPRALASDDSPERLPLLAEEATPVYSSSTKKDKIKDFLKYIYEKLKLKQIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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