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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001087`

染色体: Chr04 坐标: 15599049-15601502 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001087`
名称	SmilChr04G001087
描述	thioredoxin H9
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	15599049 - 15601502 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019824`
GeneID	`131019824`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019824`
原始查询	`LOC131019824`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin H9
产物	thioredoxin H9
Arabidopsis	`AT3G08710` (TH9) thioredoxin H-type 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820018] identity=73.9; qcov=0.957; evalue=3.94e-72; confidence=high
Rice	`Os01g0168200` (OsTRXh7) - identity=63.9; qcov=0.95; evalue=1.08e-63; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF13098 (Thioredoxin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019824

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804419.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804418.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057804418.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804418.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804418.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804418.1

150 aa

150

Thioredoxin

PF00085 Thioredoxin 28-89 aa

XP_057804419.1

140 aa

140

Thioredoxin

Thioredoxin_2

PF00085 Thioredoxin 28-127 aa PF13098 Thioredoxin_2 36-126 aa

XP_057804420.1

140 aa

140

Thioredoxin

Thioredoxin_2

PF00085 Thioredoxin 28-127 aa PF13098 Thioredoxin_2 36-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804418.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	28	89	8.2e-13	49.0	Thioredoxin
`XP_057804419.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	28	127	2.5e-23	82.7	Thioredoxin
`XP_057804419.1`	Pfam	`PF13098`	Thioredoxin_2	Domain	36	126	1.1e-09	39.3	Thioredoxin-like domain
`XP_057804420.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	28	127	2.5e-23	82.7	Thioredoxin
`XP_057804420.1`	Pfam	`PF13098`	Thioredoxin_2	Domain	36	126	1.1e-09	39.3	Thioredoxin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948437.1
ATTTCTAACAAACGAAATTGCGACAAAAGTACAAATAGGGGTGGCTAAATTAGTGCATTCTTTAATTGCTCCCACGTTTATTTTAATATTGCAAAACAAACATTTTTGTAATTTTGTTTGATTAATAGGGTAATTTGGTAACTAATTTTTTTTACTTTAAAGCTACAATTGCAATTGCGTTGGGTATTAGTTAGGCCGAGATTAGATTAGGATTAGGGTGGTTTGTCTATCTCTTATCTGTCTAATCCATCTATTCGGTT...

XM_057948436.1
AAAGCTACAATTGCAATTGCGTTGGGTATTAGTTAGGCCGAGATTAGATTAGGATTAGGGTGGTTTGTCTATCTCTTATCTGTCTAATCCATCTATTCGGTTGCGACAATACTAAATCTGTAATTCTATTTTTATATGTATAATTGGTGAAAAAGTTGTCTGTGTTTCTACCAATTCTTGCATCGGTGGCGCCGTCGTAACTGGAATCGTCTCATTTCTGACTCCGTAGCCGTCGTTGCGATAAAAGGGTGTATACTCGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131019824
ATGGGGAATTGCTTTGCTAAGCGCCATAATGATGGGGATGATTCTGATCACAATGTTGAATTTACTGGTGGAAATGTGCATCTCATCACAACCAAGGAAAGTTGGGAACAAAAGATCGACGAAGCGAAAAGAGATGGAAAGCTTGTGGTAGCCAATTTTAGCGCCACATGGTGTGGCCCTTGTAGAGTAATCGCACCTTTCTACGTGGAGCTGTCTGAGAAACACCCTTCGATAATGTGTCTCACAGTCGATGTAGATGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057804418.1
MGNCFAKRHNDGDDSDHNVEFTGGNVHLITTKESWEQKIDEAKRDGKLVVANFSATWCGPCRVIAPFYVELSEKHPSIMCLTVDVDELTVSFCSYMTINDKSYYMRGRYMSFVVCFRNLAHHGISRQLQPSSSLKTVNKSTNLSVQTSRN

XP_057804419.1
MGNCFAKRHNDGDDSDHNVEFTGGNVHLITTKESWEQKIDEAKRDGKLVVANFSATWCGPCRVIAPFYVELSEKHPSIMCLTVDVDELTEFSTSWDIKATPTFFFLKDGQQIDKLVGANKPELEKKLIAILDSMAPPWQT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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