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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001673`

染色体: Chr01 坐标: 30879665-30882603 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001673`
名称	SmilChr01G001673
描述	protein SOSEKI 3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30879665 - 30882603 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019883`
GeneID	`131019883`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019883`
原始查询	`LOC131019883`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SOSEKI 3-like
产物	protein SOSEKI 3-like
Arabidopsis	`AT2G28150` (AT2G28150) UPSTREAM OF FLC protein (DUF966) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817361] identity=46.4; qcov=1.12; evalue=1.35e-113; confidence=high
Rice	`Os03g0692400` (OsDSR5) - identity=38.4; qcov=1.01; evalue=5.6e-84; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06136 (SOK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019883

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804464.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057804464.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804464.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804464.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804464.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30880213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:30880240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B110,B60
`Chr1:30881034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,D7
`Chr1:30881170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:30881219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B8
`Chr1:30881322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B55,D5
`Chr1:30881368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr1:30881467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B25,B90,C69
`Chr1:30881475`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A3,B25,B90
`Chr1:30881475`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A3,B25,B90
`Chr1:30881482`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A3,B25,B85,B90
`Chr1:30881482`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A3,B25,B85,B90

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804464.1

505 aa

252

505

SOK

PF06136 SOK 50-137 aa

XP_057804472.1

494 aa

247

494

SOK

PF06136 SOK 50-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804464.1`	Pfam	`PF06136`	SOK	Domain	50	137	5.8e-48	161.8	SOSEKI protein DIX-like domain
`XP_057804472.1`	Pfam	`PF06136`	SOK	Domain	50	137	5.6e-48	161.9	SOSEKI protein DIX-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948489.1
CAAAATCTTGGGTCCACAAAAACTCTCAACTGAATCAACAATAGCATAACCCCACTACCATACAAACCACACTGTATCACTCCACTCCCAAATTCATAAAAAGGCCAAAAATCGAATCCACAAAAGCAAGAAAAGAAAAAAGAGCCCAAGTGGAATCACCATAAAGATTGATGCTCCTTCCCCTCAAATTCAGGCACTCACTCCCCCATCCCGTCACTCTCATCAATCTCTCTGTCATTTCATCGAACATGTGCCGGATA...

XM_057948481.1
TGGGTCCACAAAAACTCTCAACTGAATCAACAATAGCATAACCCCACTACCATACAAACCACACTGTATCACTCCACTCCCAAATTCATAAAAAGGCCAAAAATCGAATCCACAAAAGCAAGAAAAGAAAAAAGAGCCCAAGTGGAATCACCATAAAGATTGATGCTCCTTCCCCTCAAATTCAGGCACTCACTCCCCCATCCCGTCACTCTCATCAATCTCTCTGTCATTTCATCGAACATGTGCCGGATATAATTACA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019883
ATGGATGGGAGAATGAAGAAATATAGGCAGTTGAGTCCGGATAGAGCAAAAGTTTGGACTGAGAAATCTCCCAAATATCGATATAATCAACATTATAACTCTCCGCCTCCTCCGCCTCCTCCGCCGCCGCCGCATCATACTGGGAAAGTTCCGGTTGTTTACTATCTATGCCGGAATCGCCAGCTTGAGCATCCGCACTTCATGGAAGTCCCTCTGTCCAGTGATGATCTTTACTTGAGAGACGTGATTGAAAGGCTTAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804464.1
MDGRMKKYRQLSPDRAKVWTEKSPKYRYNQHYNSPPPPPPPPPPHHTGKVPVVYYLCRNRQLEHPHFMEVPLSSDDLYLRDVIERLNVLRGRGIGSLYSWSCKRSYKNGYVWHDLCDDDVIHPAHGNEYILKGSEIFEDSDPGRFSPAPTFMPCPQNQEESSSSSSLNGGTTKSSQDDELSPRLQPPCASAASPESGVGKISSWNGPLCLTEYKSEGIANASTQTDSQACAVIETGVSTDDGSLEPHQTQVSEDAERSGN...

XP_057804472.1
MDGRMKKYRQLSPDRAKVWTEKSPKYRYNQHYNSPPPPPPPPPPHHTGKVPVVYYLCRNRQLEHPHFMEVPLSSDDLYLRDVIERLNVLRGRGIGSLYSWSCKRSYKNGYVWHDLCDDDVIHPAHGNEYILKGSEIFEDSDPGRFSPAPTFMPCPQNQEESSSSSSLNGGTTKSSQDDELSPRLQPPCASAASPESGVGKISSWNGPLCLTEYKSEGIANASTQTDSQACAVIETGVSTDDGSLEPHQTQVSEDAERSGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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